合同丢失且公司与三方公司六年前已终止合作的情况下，合同一般是可以尝试补办的，但具体能否补办成功以及补办的方式会因多种因素而有所不同。以下是从不同角度为你进行的分析：
一、合同补办的可能性
双方协商补办：
- 如果合同双方（即你和公司，以及可能涉及的三方公司）都愿意配合，那么可以通过协商的方式重新签订一份与原合同内容相同的合同，或者共同出具一份证明原合同内容及双方合作情况的书面文件。这种方式最为直接和有效，但需要所有相关方的同意和配合。
依据其他证据补办：
- 如果无法直接与所有相关方协商补办，你可以尝试收集其他与合同相关的证据，如合同履行过程中的邮件、短信、聊天记录、付款凭证、发票、工作成果等。这些证据可以在一定程度上证明原合同的存在及其内容，从而作为补办合同的依据。
- 你可以向法院或仲裁机构申请，要求对方提供合同副本或相关证据。如果对方无法提供，且你提供的证据足以证明合同的存在及其内容，那么法院或仲裁机构可能会认可你的主张，并据此作出裁决。
二、合同补办的法律程序
协商程序：
- 你可以首先尝试与公司及三方公司进行协商，看是否能够达成一致意见并补办合同。协商过程中，你可以明确提出你的需求和理由，并尽量提供其他相关证据以支持你的主张。
法律程序：
- 如果协商无果，你可以考虑通过法律途径解决。具体来说，你可以向法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁，要求确认原合同的存在及其内容，并要求对方配合补办合同或承担相应的法律责任。
- 在法律程序中，你需要提供充分的证据来证明原合同的存在及其内容。这可能需要你花费一定的时间和精力来收集和整理相关证据。
三、合同补办的注意事项
及时行动：
- 由于合同已经丢失多年，且合作已经终止，因此你需要尽快采取行动来补办合同或收集相关证据。随着时间的推移，相关证据可能会逐渐消失或变得难以获取，从而增加补办合同的难度。
保留证据：
- 在补办合同或收集相关证据的过程中，你需要妥善保留所有与合同相关的文件和资料。这些证据将在后续的法律程序中发挥重要作用。
寻求专业帮助：
- 如果你在补办合同或收集相关证据的过程中遇到困难或疑问，可以寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询和法律服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。
最后需要强调的是，合同补办并非一件简单的事情，它涉及到多方面的因素和复杂的法律程序。因此，在处理此类问题时，你需要保持冷静和理性，尽可能收集充分的证据来支持自己的主张，并在必要时寻求专业律师的帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。