行政复议后判定程序违法，通常会产生以下几方面的后果：
行政行为可能被撤销或确认违法：
- 根据《中华人民共和国行政复议法》的相关规定，如果行政复议机关认为原行政行为程序违法，且该程序违法对行政行为的合法性产生了实质性影响，那么行政复议机关有权撤销该行政行为，或者确认该行政行为违法。这意味着原行政行为将失去法律效力，行政机关需要重新作出合法的行政行为。
行政机关可能需要承担赔偿责任：
- 如果程序违法的行政行为给公民、法人或其他组织造成了损害，根据《中华人民共和国国家赔偿法》的规定，行政机关可能需要承担相应的赔偿责任。这包括因行政行为违法导致的直接经济损失，以及可能的精神损害赔偿等。
对行政机关及其工作人员的纪律处分：
- 程序违法不仅可能影响行政行为的合法性，还可能反映出行政机关及其工作人员在执法过程中的不规范行为。因此，行政复议机关在判定程序违法后，可能会建议或要求相关行政机关对涉事工作人员进行纪律处分，以维护行政执法的公正性和严肃性。
影响行政机关的公信力和形象：
- 程序违法是行政机关执法过程中的一种瑕疵，它可能损害行政机关在公众心目中的公信力和形象。长期存在程序违法问题，还可能引发公众对行政机关的不信任，进而影响行政机关的正常工作和职能发挥。
针对程序违法的具体情形，行政复议机关的处理方式可能有所不同：
- 如果程序违法情节轻微，且对行政行为的合法性未产生实质性影响，行政复议机关可能会指出程序违法问题，并要求行政机关在今后的执法过程中加以改正，但不一定撤销或确认原行政行为违法。
- 如果程序违法情节严重，且对行政行为的合法性产生了实质性影响，行政复议机关则会依法撤销或确认原行政行为违法，并可能要求行政机关承担相应的赔偿责任。
建议：
- 对于公民、法人或其他组织而言，如果认为行政机关的行政行为程序违法，可以依法向行政复议机关申请行政复议，以维护自己的合法权益。
- 对于行政机关而言，应严格遵守法定程序，确保行政行为的合法性和公正性。同时，应加强对执法人员的培训和管理，提高执法人员的法律素养和执法水平，以减少程序违法问题的发生。
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