针对您提出的问题，即“行为人违法且未退出违法所得，目前行为人已死亡，如何进行行政处罚”，以下是我的详细解答：
首先，我们需要明确一个基本原则：当违法人死亡后，一般不再对其进行行政处罚。这一原则主要基于以下几点考虑：
法律主体资格的消亡：
- 行政处罚的对象是实施了违反行政法律法规的单位或个人。一旦违法人死亡，其作为法律主体的资格也随之消亡，无法再承担行政责任或接受相应的行政处罚。
行政处罚目的的无法实现：
- 行政处罚旨在惩戒违法、教育警示并维护社会秩序和公共利益。当违法人死亡后，对其实施行政处罚已无法实现惩戒和教育本人的目的，因为死者无法感受到处罚带来的不利后果。
责任承担主体的消灭：
- 行政处罚是针对特定的违法主体实施的。违法人死亡意味着责任承担主体的消灭，此时若继续进行行政处罚，缺乏实际的责任承担对象，行政处罚也就失去了实际意义和执行可能性。
然而，这并不意味着违法人死亡后，其生前的违法行为就可以被忽视或逃避法律责任。具体来说：
民事赔偿责任：
- 如果违法行为造成了他人人身伤害或财产损失，其遗产继承人需要在继承遗产的范围内承担相应的民事赔偿责任。这是基于民事法律关系的原则，即“谁受益，谁负责”。
违法事实的调查与处理：
- 对于生前存在的违法行为，即使违法人已经死亡，相关部门仍然可以依法进行调查，明确其违法事实。虽然不再对违法人本人进行行政处罚，但可以公开相关信息，以起到警示和教育作用。
刑事责任的特殊情况：
- 如果违法行为构成犯罪，即使犯罪嫌疑人死亡，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的规定，也不追究刑事责任。但已经追究的，应当撤销案件、不起诉、终止审理或宣告无罪。这是刑事法律对犯罪嫌疑人死亡后的特殊处理规定。
针对您提到的“未退出违法所得”的情况，如果这部分违法所得属于违法行为造成的他人财产损失，那么其遗产继承人同样需要在继承遗产的范围内承担退还责任。如果违法所得被用于违法活动或造成了其他不良社会影响，相关部门也可以依法采取其他措施进行处理。
综上所述，虽然违法人死亡后一般不再对其进行行政处罚，但其生前的违法行为仍可能受到法律的调查和处理，且其遗产继承人需承担相应责任。这一原则既体现了法律的公正性，也兼顾了实际情况的可操作性。希望以上解答能够对您有所帮助。