运输合同案件在满足一定条件下是可以申请执行的。具体来说，可以从以下几个角度来详细分析：

1. 执行依据的存在：

   • 要申请执行，首先必须有一个具有法律效力的执行依据，这通常指的是法院作出的生效判决、裁定或调解书，或者是仲裁机构作出的仲裁裁决书等。在运输合同案件中，如果双方因合同纠纷诉至法院，并且法院作出了有利于一方的判决或裁定，那么该判决或裁定就可以作为申请执行的依据。

2. 被执行人未履行义务：

   • 申请执行的另一个前提是被执行人（即败诉方）未在规定期限内履行判决或裁定所确定的义务。如果被执行人已经自觉履行了义务，那么就没有必要再申请执行了。

3. 申请执行的程序：

   • 申请执行需要遵循一定的程序。通常，申请执行人需要向法院提交执行申请书，并提供相关证据材料，如生效的法律文书、被执行人的财产状况等。法院在受理申请后，会进行审查，并决定是否立案执行。

4. 执行措施的实施：

   • 一旦法院决定立案执行，就会采取一系列执行措施，如查询、冻结、划拨被执行人的银行存款，查封、扣押、拍卖被执行人的财产等，以迫使被执行人履行义务。

5. 特殊情况下的执行：

   • 在运输合同案件中，如果涉及的是跨境运输或国际运输，那么执行过程可能会更加复杂。此时，可能需要考虑国际条约、双边协议或互惠原则等因素，以确定执行的管辖法院和执行程序。

建议：

• 如果您在运输合同案件中获得了生效的法律文书，并且被执行人未履行义务，那么您可以向法院申请执行。
• 在申请执行前，建议您先了解被执行人的财产状况，以便在执行过程中能够更有效地追讨欠款或货物。
• 如果您对执行程序或执行措施有任何疑问，可以随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。