结论：股份是否有效取决于多个因素，包括合同的签订情况、合同内容、双方是否履行了合同义务以及是否已经进行了相关的工商变更登记等。即使双方不再一起合作，股份的有效性也并不直接因此而受影响。下面我将从不同角度详细分析这个问题。

1. 合同签订与内容：

   • 首先，要确认你们之间签订的合同是否合法有效。合同应当是双方真实意思的表示，且内容不违反法律法规的强制性规定。如果合同本身存在瑕疵，如欺诈、胁迫、重大误解等情形，那么合同可能被认定为无效或可撤销。
   • 其次，合同中关于股份的约定应当明确具体，包括股份的比例、权益、义务等。如果合同中对股份的约定模糊不清或存在歧义，那么在后续执行过程中可能会产生争议。

2. 合同履行情况：

   • 双方是否按照合同的约定履行了各自的义务，如出资、提供资源、参与管理等。如果一方未履行合同义务，另一方有权要求其履行或承担违约责任。
   • 在股份方面，如果合同约定了股份的转让或变更条件，那么双方应当按照约定进行操作。例如，如果合同约定了股份转让需要经过其他股东同意或需要进行工商变更登记等，那么这些条件应当得到满足。

3. 工商变更登记：

   • 股份的有效性还与是否进行了工商变更登记有关。如果双方已经签订了股份转让合同，但未进行工商变更登记，那么从法律上讲，股份可能仍然属于原股东。因此，为了确保股份的有效性，双方应当及时办理工商变更登记手续。

4. 不再合作的影响：

   • 双方不再一起合作，并不直接导致股份无效。股份的有效性主要取决于合同的签订和履行情况，以及是否进行了工商变更登记。即使双方不再合作，如果合同仍然有效且已经履行了相关义务，那么股份仍然应当受到法律保护。
   • 然而，如果双方因为不再合作而产生争议，如股份归属、利润分配等，那么这些争议应当通过协商、调解或诉讼等方式解决。

建议：

• 如果你对股份的有效性存在疑问，建议先仔细审查合同内容，确认合同的签订和履行情况。
• 如果合同中存在不明确或存在争议的地方，建议与对方进行协商，寻求解决方案。
• 如果协商无果，你可以考虑寻求法律援助或提起诉讼，以维护自己的合法权益。

在处理这类问题时，请务必保持冷静和理性，通过合法途径解决争议。如果你有任何进一步的法律问题或需要更具体的建议，请随时向我咨询。