关于在职年假补偿的追诉期限，这确实是一个涉及多个法律条款和司法实践的问题。以下是我为您详细梳理和解答的内容：
一、基本规定
劳动仲裁时效：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间通常为一年。这意味着，如果您发现公司未依法支付年假工资，您通常需要在知道或应当知道这一权利被侵害之日起的一年内提起劳动仲裁。
工资支付记录保存期限：
- 原劳动部《工资支付暂行规定》要求用人单位保存两年以上的工资支付记录。因此，在两年内，如果公司声称已安排年休假或已支付年假工资，那么公司需要承担举证责任。超过两年，您可能需要承担更重的举证责任来证明公司未支付年假工资。
二、特殊情形下的追诉期限
跨年安排情况：
- 如果您书面同意年休假跨年安排，那么根据相关规定，您最多可以追索三年的年休假工资。这是因为跨年安排可能涉及多个年度的年休假和工资支付，因此允许更长的追诉期限。
- 如果未经书面同意跨年安排，则通常最多可追索两年的年休假工资。
时效中断与中止：
- 在仲裁时效期间内，如果您或公司主张权利、请求救济或对方同意履行义务，仲裁时效可能会中断并重新计算。
- 如果因不可抗力或其他正当理由导致您无法申请仲裁，仲裁时效可能会中止，待原因消除后继续计算。
劳动关系存续期间的特殊情况：
- 在劳动关系存续期间，如果因拖欠劳动报酬（包括年假工资）发生争议，您申请仲裁不受一年时效期间的限制。
- 但是，一旦劳动关系终止，您应自劳动关系终止之日起一年内提出相关主张。
三、实际操作中的建议
及时主张权利：
- 鉴于年假工资的追诉期限可能受到多种因素的影响，我建议您在发现公司未依法支付年假工资后，尽快咨询专业律师或相关法律机构，了解当地的法律规定和司法实践，并在规定的时间内及时采取行动。
保存相关证据：
- 为了支持您的主张，您需要保存与年假相关的证据，如公司未安排年休假的通知、您未休年休假的记录、公司未支付年假工资的工资单等。这些证据将有助于您在劳动仲裁或诉讼中证明自己的权益。
与公司协商：
- 在采取法律行动之前，您也可以尝试与公司进行协商，寻求和解或调解。这可能是一种更快速、更经济的解决方式，同时也有助于维护您与公司的良好关系。
综上所述，年假工资的追诉期限是一个复杂且灵活的问题，受到多个法律条款和司法实践的影响。为了确保您的合法权益得到有效保护，我建议您在了解相关法律规定的基础上，及时采取行动并保存相关证据。