针对您提出的“没有加盖单位公章但有项目负责人签字怎么办”的问题，这确实是一个涉及合同效力和法律责任认定的常见问题。以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，公章的加盖并非合同生效的唯一条件。在合同实务中，公章的加盖主要是为了证明合同是公司的真实意思表示，并确认合同内容的法律效力。然而，当合同或相关文件上没有加盖公章，但有项目负责人或法定代表人等有权代表公司签字时，我们并不能直接否定该合同或文件的法律效力。
一、项目负责人签字的法律效力
代表权或代理权：项目负责人作为公司的一员，如果其职权涵盖对相关事务的核对与确认，那么其在合同或文件上的签字行为，可以视为公司的行为。这是因为，签字行为的本质在于表明签字人具有代表公司或代理公司进行某种法律行为的权限。
交易习惯与合理信赖：在商业交易中，交易相对人往往基于对项目负责人身份和职权的合理信赖，而接受其签字作为合同或文件的有效凭证。如果项目负责人的签字行为符合交易习惯，且交易相对人没有理由怀疑其签字行为的真实性或有效性，那么该签字行为应当被认定为有效。
二、未加盖公章的影响及应对
合同效力：虽然公章的加盖是合同生效的一种常见方式，但并非唯一方式。如果合同或文件上有项目负责人的有效签字，且该签字行为能够代表公司的真实意思表示，那么即使未加盖公章，该合同或文件仍然可能具有法律效力。
后续补救措施：如果合同或文件未加盖公章，但项目负责人已经签字确认，为了降低法律风险，建议尽快与公司沟通，要求加盖公章或出具书面确认函，以进一步证明合同或文件的有效性。
法律救济途径：如果公司拒绝加盖公章或出具书面确认函，且因此导致合同或文件无法履行或产生纠纷，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。例如，您可以向法院提起诉讼，要求确认合同或文件的有效性，并要求公司承担相应的法律责任。
三、具体案例分析
以您提供的案例为例，乙公司项目负责人在结算单上签字确认，但乙公司迟迟未加盖公章。然而，法院经审理认为，项目负责人的签字行为代表甲、乙双方已就租金金额达成一致意见，故两张结算单应作为租金支付义务的有效凭证。这一判决充分说明了项目负责人签字在合同或文件中的法律效力。
四、建议
完善合同条款：在签订合同时，建议明确约定合同生效的条件和方式，包括公章的加盖、项目负责人的签字等，以降低法律风险。
保留证据：在合同履行过程中，建议妥善保留与项目负责人签字相关的所有证据，包括结算单、对账单、沟通记录等，以备不时之需。
及时沟通：如果发现合同或文件未加盖公章，建议及时与公司沟通，要求加盖公章或出具书面确认函，以确保合同或文件的有效性。
综上所述，没有加盖单位公章但有项目负责人签字的合同或文件，并不一定无效。关键在于项目负责人的签字行为是否能够代表公司的真实意思表示，以及交易相对人是否对此产生了合理信赖。如果满足这些条件，那么该合同或文件仍然可能具有法律效力。