结论：邻居将集体宅基地转为国有土地证并盖自建房的行为是否合法，需根据具体情况判断，主要包括是否符合法定程序、是否获得相关部门批准以及是否满足土地用途规划等条件。以下从多个角度详细分析：

1. 土地性质转变的合法性

• 集体土地转国有土地的程序：根据《中华人民共和国土地管理法》及相关规定，集体土地转为国有土地需经过法定程序，包括土地征收、审批、公告等环节。若邻居未经合法程序，擅自将集体宅基地转为国有土地，该行为显然违法。
• 土地用途规划：即使土地性质合法转变为国有土地，也需符合土地用途规划。若邻居将土地用于非住宅建设（如商业、工业等），或未按照规划要求建设，同样可能构成违法。

2. 自建房的合法性

• 建设许可：在国有土地上建设自建房，需取得《建设工程规划许可证》和《施工许可证》等相关证件。若邻居未取得这些证件，擅自建设，则属于违法建设。
• 建筑标准：自建房还需符合建筑安全、消防等标准。若邻居建设的房屋存在安全隐患或违反消防规定，同样可能面临法律责任。

3. 相邻权与土地使用权

• 相邻权：邻居在建设自建房时，需尊重其他相邻业主的合法权益，如采光、通风、排水等。若邻居的建设行为侵犯了您的相邻权，您有权要求其停止侵害、排除妨碍或赔偿损失。
• 土地使用权：若邻居的建设行为超出了其土地使用权范围，侵占了您的土地或公共空间，您同样有权要求其停止侵害并恢复原状。

4. 法律后果与维权途径

• 行政处罚：若邻居的行为违反了土地管理、城乡规划等相关法律法规，相关部门有权对其进行行政处罚，包括罚款、责令拆除违法建筑等。
• 民事诉讼：若邻居的行为侵犯了您的合法权益，您有权向人民法院提起民事诉讼，要求其承担民事责任，如停止侵害、赔偿损失等。

5. 建议与行动

• 核实土地性质与用途：首先，您需要核实邻居所使用的土地是否确实已合法转变为国有土地，并了解该土地的具体用途规划。
• 检查建设许可与建筑标准：其次，检查邻居是否取得了合法的建设许可，并确认其建设的房屋是否符合建筑安全、消防等标准。
• 咨询专业律师：若您对上述情况存在疑问或认为邻居的行为侵犯了您的合法权益，建议直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律意见和维权方案。

总结：邻居将集体宅基地转为国有土地证并盖自建房的行为是否合法，需综合考虑土地性质转变的合法性、自建房的合法性、相邻权与土地使用权以及法律后果与维权途径等多个方面。若您对此存在疑问或认为邻居的行为侵犯了您的合法权益，请直接向我咨询，我将竭诚为您提供专业的法律帮助。