结论：在合同纠纷申请仲裁后，案件被公安立案的情况下，仲裁是否受理取决于案件的具体性质以及公安立案的原因。以下从不同角度进行分析：
合同纠纷与刑事案件的独立性
- 合同纠纷通常属于民事法律关系范畴，由仲裁机构或法院根据合同条款和法律规定进行裁决。
- 公安立案通常意味着案件可能涉及刑事犯罪，如诈骗、合同诈骗等。刑事案件的侦查和审理由公安机关和检察院、法院负责。
- 一般情况下，合同纠纷的仲裁申请与刑事案件的立案是独立的。仲裁机构在受理合同纠纷时，主要关注合同本身的内容和双方当事人的权利义务关系，而不会因为案件被公安立案就自动拒绝受理。
公安立案对仲裁受理的可能影响
- 如果公安立案的案件与合同纠纷有直接关联，且涉及同一事实或法律关系，仲裁机构可能会考虑案件的复杂性，以及是否存在需要等待刑事案件审理结果的情况。
- 在某些情况下，如果仲裁机构认为合同纠纷的解决依赖于刑事案件的审理结果（例如，合同的有效性取决于是否存在刑事犯罪行为），仲裁机构可能会决定中止仲裁程序，等待刑事案件的审理结果。
- 然而，这并不意味着仲裁机构会直接拒绝受理。仲裁机构会根据具体情况，权衡利弊，作出是否受理或中止仲裁的决定。
实际操作中的建议
- 如果您已经申请了仲裁，且案件被公安立案，建议您及时与仲裁机构沟通，说明情况，并提供相关证据材料。
- 仲裁机构会根据您提供的材料和案件的具体情况，决定是否受理或中止仲裁程序。
- 同时，您也可以咨询我，了解案件的具体性质和可能的法律后果，以便更好地应对接下来的法律程序。
特殊情况下的处理
- 如果合同纠纷本身就涉及刑事犯罪（如合同诈骗），且公安已经立案侦查，那么仲裁机构在受理时可能会更加谨慎。
- 在这种情况下，仲裁机构可能会要求您提供更多的证据材料，以证明合同纠纷的独立性和可仲裁性。
- 如果仲裁机构认为案件涉及刑事犯罪，且该犯罪行为对合同纠纷的解决有重大影响，仲裁机构可能会决定不受理或中止仲裁程序，并建议您通过刑事诉讼途径解决争议。
总结与建议：合同纠纷申请仲裁后案件被公安立案，并不意味着仲裁机构会直接拒绝受理。仲裁机构会根据案件的具体性质、公安立案的原因以及双方提供的证据材料来作出决定。如果您遇到此类情况，建议及时与仲裁机构沟通，并咨询我，以便更好地了解案件的法律后果和应对策略。