结论：农村里别人的井打在您的耕地内，即使对方已经办了取水证，这一行为仍然可能是违法的，具体取决于多种因素，包括对方是否获得了您的同意、是否符合相关规划以及是否侵犯了您的土地使用权等。

分析：

1. 土地使用权问题：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，土地使用权人依法对国家所有的土地享有占有、使用和收益的权利，有权利用该土地建造建筑物、构筑物及其附属设施。如果别人的井打在您的耕地内，且未经您的同意，那么这很可能侵犯了您的土地使用权。

2. 取水证与土地使用权的冲突：

   • 取水证是允许持证人从特定水源取水的法律凭证，但它并不赋予持证人在他人土地上挖井的权利。即使对方获得了取水证，如果挖井的位置在您的耕地内，且未经您同意，那么对方的行为仍然可能构成违法。

3. 规划与审批问题：

   • 在农村地区，挖井等建设活动通常需要经过相关部门的规划和审批。如果对方在挖井前没有获得必要的规划和审批手续，那么这一行为也是违法的。

4. 侵权责任与赔偿：

   • 如果对方的行为确实侵犯了您的土地使用权，您有权要求对方停止侵权行为，并可能要求对方赔偿因此造成的损失。这包括但不限于土地恢复费用、农作物损失等。

建议：

• 与对方沟通：首先，您可以尝试与对方沟通，了解对方挖井的具体情况和原因，并表达您的担忧和诉求。如果对方愿意配合，双方可以协商解决方案，如调整井的位置、给予您一定的补偿等。

• 收集证据：如果沟通无果，您需要收集相关证据来证明对方的行为侵犯了您的土地使用权。这包括但不限于土地使用权证、现场照片、证人证言等。

• 寻求法律帮助：如果对方拒绝配合或您无法自行解决问题，您可以寻求法律帮助。作为专业律师，我可以为您提供法律咨询和代理服务，帮助您维护自己的合法权益。

• 向相关部门投诉：您还可以向当地土地管理部门或水利部门投诉对方的行为。这些部门有权对违法行为进行调查和处理，并可能要求对方停止侵权行为并恢复原状。

后续行动：

• 在采取任何行动之前，请确保您已经充分了解了相关法律法规和政策要求，并咨询了专业律师的意见。
• 如果您决定通过法律途径解决问题，请准备好相关证据和材料，并按照法律程序进行操作。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。