关于工伤认定是由公司还是个人申请最好，这个问题其实并没有一个绝对的答案，因为它取决于多种因素，包括公司的配合程度、个人对流程的了解以及具体情况的紧急程度等。不过，我可以从法律规定的角度，为您详细分析一下两者的优缺点，帮助您做出更合适的选择。

首先，从法律规定的角度来看，职工所在用人单位是承担首要工伤申报义务的主体。这意味着，在事故伤害发生或者职业病被确诊后的30日内，公司有责任向社会保险行政部门提出工伤认定申请。如果公司能够及时、准确地完成这一流程，那么对于受伤职工来说，无疑是最快捷、最方便的途径。因为公司通常更熟悉工伤认定的流程和要求，能够更有效地准备和提交相关材料。

然而，如果公司出于某种原因（如拖延、不配合等）未能在规定时间内提出申请，或者受伤职工对公司的申请存在疑虑（如担心公司可能隐瞒或歪曲事实），那么工伤职工或者其近亲属，以及工伤职工所在用人单位的工会组织也有权在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内提出工伤认定申请。这种情况下，个人或近亲属申请可以作为一种有效的补充或替代方式，确保受伤职工的权益得到保障。

具体来说，个人或近亲属申请工伤认定的优点在于：

1. 自主性更强：个人或近亲属可以根据自己的情况和需求，灵活选择申请的时间和方式。
2. 更直接地维护权益：如果担心公司可能不配合或存在其他不利因素，个人或近亲属申请可以更直接地维护受伤职工的权益。

但个人或近亲属申请也存在一些挑战，比如：

1. 流程可能不熟悉：个人或近亲属可能对工伤认定的流程和要求不太了解，需要花费更多时间和精力去了解和准备。
2. 材料准备可能更复杂：相比公司申请，个人或近亲属可能需要准备更多的材料来证明工伤事实和劳动关系等。

因此，我的建议是：如果公司能够积极配合、及时提出工伤认定申请，并且您对公司的申请没有疑虑，那么最好由公司来申请；如果公司不配合或者您对公司的申请存在疑虑，那么您可以考虑由个人或近亲属来申请工伤认定。无论哪种方式，都请确保在规定的时间内提出申请，并准备好相关的材料和证据。