针对您提出的“公司员工非法集资造成员工损失该怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、法律责任分析
刑事责任：
- 若员工直接参与非法集资活动，如宣传、招揽客户、收款等，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能构成非法吸收公众存款罪或集资诈骗罪，面临有期徒刑、拘役、罚金等刑事处罚。
- 员工在非法集资活动中的角色和参与程度将直接影响其刑事责任的轻重。主犯或组织、领导者将面临更严厉的刑罚，而从犯或受胁迫、诱骗参与的员工则可能从轻、减轻或免除处罚。
行政责任：
- 对于情节较轻、未构成犯罪的行为，员工可能面临警告、罚款、没收违法所得等行政处罚，依据《防范和处置非法集资条例》等相关法规执行。
民事责任：
- 员工因参与非法集资给投资者（包括公司其他员工）造成损失的，需承担民事赔偿责任。这意味着员工可能需要赔偿因其非法行为导致的直接经济损失。
二、处理原则与措施
区分主犯与从犯：
- 对组织、策划、实施非法集资的主要人员（主犯），应依法从严惩处，以维护金融秩序和社会稳定。
- 对被胁迫、诱骗参与且作用较小的从犯，可依法从轻、减轻处罚，体现教育与惩戒相结合的原则。
考虑主观故意与过失：
- 明知是非法集资仍积极参与的，按故意犯罪处理，追究其刑事责任。
- 因疏忽大意或过于自信导致参与的，需结合具体情况认定责任，可能减轻处罚或免于刑事处罚，但仍需承担行政或民事责任。
退赃与悔罪表现：
- 鼓励员工主动退还违法所得、积极配合调查、有悔罪表现，这些行为可能作为从宽处理的依据，减轻其法律责任。
企业内部处理：
- 企业应根据《劳动合同法》等相关规定，对参与非法集资的员工解除劳动合同，以维护企业形象和内部秩序。
- 通过法律途径追缴员工因非法集资获得的收入，减少企业损失，并可能作为民事赔偿的来源。
三、建议与注意事项
加强法律教育：
- 企业应定期组织法律知识培训，提高员工的法律意识和风险防范能力，避免类似事件再次发生。
建立合规文化：
- 营造诚信经营的企业氛围，明确禁止任何形式的非法集资活动，建立举报机制，鼓励员工积极举报违规行为。
及时报案与配合调查：
- 一旦发现非法集资线索，企业应立即向公安机关报案，并积极配合调查工作，提供必要的信息和证据。
关注员工损失与赔偿：
- 对于因非法集资活动受到损失的员工，企业应关注其赔偿情况，协助其通过法律途径维护自身权益。
综上所述，公司员工非法集资造成员工损失的处理需要综合考虑法律责任、处理原则与措施以及建议与注意事项等多个方面。企业应积极应对，依法处理，同时加强法律教育和合规文化建设，以防范类似事件的发生。