协议抵账在破产时是否有效，需根据具体情况判断，主要取决于协议抵账行为是否符合法律规定、是否在破产申请受理前完成，以及是否存在恶意串通损害其他债权人利益等情形。以下从不同角度为您详细分析：

1. 协议抵账行为本身的合法性

• 合法有效的协议抵账：如果协议抵账行为是双方真实意思表示，内容不违反法律、行政法规的强制性规定，且不存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形，那么该协议在破产前通常是有效的。这意味着，在破产程序中，该抵账行为可能被认可，相关债权可能按照抵账协议的约定得到清偿。
• 无效或可撤销的协议抵账：如果协议抵账行为存在上述违法或不当情形，如恶意串通损害其他债权人利益、以明显不合理的低价转让财产等，那么该协议在破产程序中可能被认定为无效或可撤销。此时，相关债权可能无法按照抵账协议的约定得到清偿，而是需要按照破产法的规定进行统一分配。

2. 破产申请受理前后的影响

• 破产申请受理前完成的协议抵账：如果协议抵账行为在破产申请受理前已经完成，且符合上述合法有效的条件，那么该抵账行为在破产程序中通常会被认可。但是，如果管理人发现该抵账行为存在损害其他债权人利益的情形，如低价转让财产等，管理人有权请求人民法院予以撤销。
• 破产申请受理后进行的协议抵账：根据《企业破产法》的规定，人民法院受理破产申请后，债务人对个别债权人的债务清偿无效。这意味着，在破产申请受理后，债务人不得再通过协议抵账等方式对个别债权人进行清偿，否则该清偿行为无效。

3. 管理人的审查与撤销权

• 管理人的审查职责：在破产程序中，管理人负责接管债务人的财产、印章和账簿、文书等资料，调查债务人财产状况，制作财产状况报告。在这个过程中，管理人会对债务人的所有财产处分行为进行审查，包括协议抵账行为。
• 管理人的撤销权：如果管理人发现债务人在破产申请受理前一定期限内（通常为六个月至一年，具体根据法律规定和案件情况而定）存在无偿转让财产、以明显不合理的价格进行交易、对没有财产担保的债务提供财产担保、对未到期的债务提前清偿、放弃债权等损害其他债权人利益的行为，管理人有权请求人民法院予以撤销。这意味着，即使协议抵账行为在破产申请受理前已经完成，但如果存在上述情形，管理人仍有可能通过法律程序撤销该抵账行为。

4. 实际操作中的建议

• 确保协议抵账的合法性：在进行协议抵账时，应确保双方意思表示真实、内容合法合规，并避免存在欺诈、胁迫、恶意串通等情形。
• 及时完成抵账手续：尽量在破产申请受理前完成协议抵账的所有手续，以降低被撤销的风险。
• 咨询专业律师：由于破产程序涉及复杂的法律问题和程序要求，建议在进行协议抵账或面临破产情况时，及时咨询专业律师以获取针对性的法律建议和帮助。

总结来说，协议抵账在破产时是否有效需根据具体情况判断。为了确保自身权益得到保障，建议在进行相关操作时谨慎行事，并咨询专业律师的意见。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。