留置期间认罪认罚后，案件仍有可能移交检察院审查起诉，但存在特殊情形下可能不移交的情况，不过这种情况较为少见且需满足严格条件。以下从不同角度为你详细分析：

留置与移交检察院的常规流程

留置是监察机关在调查职务违法和职务犯罪时采取的一项限制被调查人人身自由的强制措施。在留置期间，监察机关会全面收集证据，查明案件事实。一般情况下，当监察机关认为案件事实已经查清，证据确实、充分，需要追究被调查人刑事责任时，就会将案件移送检察院审查起诉。这是刑事诉讼程序中的常规流程，认罪认罚并不会直接改变这一流程的走向。例如，某公职人员因涉嫌贪污被留置，在留置期间如实供述了自己的犯罪行为，监察机关在完成调查后，依然会将案件移送检察院，由检察院进一步审查并决定是否提起公诉。

可能不移交检察院的特殊情形

1. 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪
   • 如果在留置期间，经过深入调查发现，被调查人的行为虽然存在一定违法性，但情节显著轻微，对社会造成的危害不大，根据刑法的规定不构成犯罪。那么在这种情况下，即使被调查人认罪认罚，监察机关也不会将案件移送检察院。比如，某公职人员收受了他人少量财物，但属于人情往来范畴，且没有为对方谋取不正当利益，经过调查认定不构成受贿罪，那么案件就不会进入检察院审查起诉阶段。
2. 犯罪已过追诉时效期限
   • 刑法规定了犯罪的追诉时效期限，不同犯罪根据其法定最高刑的不同，追诉时效期限也有所不同。如果在留置期间发现被调查人的犯罪行为已经过了追诉时效期限，那么即使其认罪认罚，监察机关也不会再将案件移送检察院。例如，某犯罪行为法定最高刑为5年有期徒刑，经过20年后才发现该犯罪行为，此时已经超过了追诉时效期限，案件就不会继续进入刑事诉讼程序。
3. 经特赦令免除刑罚
   • 如果国家颁布了特赦令，而被调查人的犯罪行为符合特赦的条件，那么即使其在留置期间认罪认罚，案件也不会移送检察院。比如，在某些特定的历史时期，国家为了体现人道主义精神或促进社会和谐，会对一些特定类型的犯罪人员进行特赦，被特赦的人员就不再追究其刑事责任。
4. 依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉
   • 刑法中有一些犯罪是属于告诉才处理的犯罪，如侮辱罪、诽谤罪等（严重危害社会秩序和国家利益的除外）。如果被调查人涉嫌的是这类犯罪，且被害人没有告诉或者告诉后又撤回告诉，那么即使被调查人认罪认罚，案件也不会移送检察院。例如，甲侮辱了乙，乙一开始向监察机关告诉了甲的犯罪行为，但后来乙考虑到各种因素又撤回了告诉，那么甲的案件就不会进入检察院审查起诉阶段。

认罪认罚对案件移交的影响

认罪认罚是被调查人的一种态度表现，它可以在一定程度上反映被调查人的悔罪表现。在留置期间认罪认罚，监察机关在调查时会将其作为一个重要的情节予以考虑。如果被调查人真诚认罪认罚，积极配合调查，如实交代自己的犯罪事实，可能会对案件的定性、量刑等方面产生积极影响。但这并不意味着认罪认罚就一定不会移交检察院，关键还是要看案件是否符合上述可能不移交检察院的特殊情形。

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