政府派人监督村民填选票的行为是否合法，需分情况讨论：

1. 监督主体与程序合法性
   根据《村民委员会组织法》第十五条，选举村民委员会时，应当设立秘密写票处，并由村民选举委员会主持投票。政府本身并非选举的直接组织者，但若政府受村民选举委员会邀请，或基于《村民委员会组织法》第三十六条的“指导、支持和帮助”职责，派员到场监督选举流程（如维持秩序、防止舞弊），且不干预村民独立填票，则属于合法行为。
   关键点：监督人员需保持中立，不得直接观察或指导村民填票内容，否则可能侵犯村民选举权。

2. 干预填票内容的违法性
   若政府派员直接监督村民填票过程（如站在选民身后、要求选民公开投票选择），则属于违法行为。
   法律依据：

• 《村民委员会组织法》第十七条明确规定，“选举实行无记名投票、公开计票的方法，选举结果应当当场公布。选举时，应当设立秘密写票处”。
  
• 秘密投票是村民选举权的核心保障，任何组织或个人不得以任何方式干扰选民独立表达意愿。
  后果：此类行为可能被认定为“破坏选举”，需承担行政责任（如责令改正、通报批评）或刑事责任（如《刑法》第二百五十六条的“破坏选举罪”）。

1. 特殊情形：村民自治的边界
   若村民会议或村民代表会议通过决议，主动邀请政府派员监督选举流程（如因历史选举纠纷需第三方见证），且决议内容不违反法律强制性规定（如不涉及填票内容干预），则可能被认定为合法。但此类情形需严格符合《村民委员会组织法》第二十二条的村民会议决议程序，且政府角色仍限于“流程监督”而非“内容干预”。

建议：

• 若村民认为政府派员监督行为违法，可向乡镇人民政府反映，要求其责令改正；
  
• 若监督行为已实际影响选举结果，可依据《村民委员会组织法》第三十六条向县级人民政府民政部门投诉，或依法申请人民法院撤销选举结果。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律应对方案。