结论：中智直签三方协议的员工是否算正式员工，不能一概而论，需结合协议具体内容、用工形式及企业内部管理制度综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、协议性质与用工形式
三方协议与劳动合同的区别：
- 三方协议，通常指由毕业生、用人单位和学校三方共同签订的就业意向协议，它主要明确毕业生到用人单位就业的意向，并约定报到、签约等后续事宜，并不直接等同于劳动合同。
- 劳动合同则是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议，具有法律约束力，是判断员工是否为正式员工的关键依据。
中智直签三方协议的情况：
- 若中智作为用人单位直接与员工签订三方协议，并后续签订了正式的劳动合同，则该员工应被视为中智的正式员工，享受企业规定的各项福利待遇。
- 若中智仅作为中介或派遣单位签订三方协议，员工实际被派往其他合作单位工作，则该员工可能不属于中智的正式员工，而是派遣员工，其工作稳定性和福利待遇可能与正式员工有所差异。
二、企业内部管理制度
中智的用工形式：
- 中智作为中央管理的国有重点骨干企业，其用工形式可能包括劳动合同制员工、派遣员工、实习生、兼职员工等。
- 正式员工通常指与中智直接签订劳动合同的员工，他们享受企业规定的各项福利待遇，工作相对稳定，职业发展路径明确。
“正式编制”的灵活性：
- 在中智这样的市场化运作企业中，“正式编制”并非法律上的严格定义，而是与用人单位的内部管理制度和福利待遇体系紧密相关。
- 因此，即使员工与中智签订了三方协议，也不能直接判断其是否为正式员工，还需结合后续签订的劳动合同及企业内部管理制度来综合判断。
三、法律建议与指导
审查协议内容：
- 在签订三方协议时，员工应仔细审查协议内容，明确协议的性质、目的及后续安排，特别是关于是否签订正式劳动合同、工作岗位、薪资待遇等关键条款。
咨询企业内部规定：
- 员工可咨询中智的招聘部门或相关负责人，了解企业内部关于正式员工的定义、用工形式及福利待遇等规定，以便更准确地判断自己的身份。
保留相关证据：
- 在签订协议及后续工作过程中，员工应保留好相关证据，如协议文本、劳动合同、工资单、工作证等，以便在发生纠纷时维护自己的合法权益。
总结：中智直签三方协议的员工是否算正式员工，需结合协议具体内容、用工形式及企业内部管理制度综合判断。员工在签订协议前应仔细审查协议内容，并咨询企业内部规定，以明确自己的身份和权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。