结论：公司安排砍疫木却砍了活树的责任承担问题，需根据具体情况来判断，一般可能涉及公司责任、员工个人责任或双方共同责任。以下是对此问题的详细分析：
一、公司责任
管理责任：
- 如果公司未对砍伐活动进行充分的管理和监督，导致员工误砍活树，公司可能需要承担管理不善的责任。这包括未提供明确的砍伐指示、未进行必要的现场监督或未采取防止误砍的措施等。
合同责任：
- 如果公司与相关方（如林业部门、土地所有者等）签订了砍伐合同，并明确约定了砍伐范围、对象等条款，而公司违反了这些条款，砍伐了活树，那么公司可能需要承担违约责任，赔偿因此给对方造成的损失。
法律责任：
- 根据相关法律法规，如《森林法》等，未经许可擅自砍伐活树可能构成违法行为。如果公司被认定为违法行为的主体，将可能面临行政处罚或刑事责任。
二、员工个人责任
故意或重大过失：
- 如果员工在砍伐过程中存在故意或重大过失，如明知是活树而故意砍伐，或者因疏忽大意而误砍活树，且这种过失与损害结果之间存在直接因果关系，那么员工可能需要承担个人责任。
违反公司规定：
- 如果公司有明确的砍伐规定和操作流程，而员工违反了这些规定和流程，导致误砍活树，员工也可能需要承担一定的责任。
三、双方共同责任
- 在某些情况下，公司和员工可能都需要对误砍活树的行为承担责任。例如，公司未提供充分的培训和指导，导致员工无法准确识别疫木和活树；或者员工在砍伐过程中存在过失，而公司未及时进行纠正和制止等。
法律建议：
立即停止砍伐：
- 一旦发现误砍活树的情况，应立即停止砍伐活动，防止损害进一步扩大。
调查原因：
- 对误砍活树的原因进行调查，明确是公司管理不善、员工个人过失还是其他原因导致的。
协商赔偿：
- 根据调查结果，与相关方（如林业部门、土地所有者等）进行协商，就赔偿事宜达成一致意见。
加强管理和培训：
- 公司应加强对砍伐活动的管理和监督，提供必要的培训和指导，确保员工能够准确识别疫木和活树，并遵守相关法律法规和公司规定。
寻求法律帮助：
- 如果无法就赔偿事宜达成一致意见，或者面临法律纠纷和处罚，建议及时寻求专业律师的法律帮助，以维护自身合法权益。
后续行动：
- 如果你或公司面临此类问题，建议直接向我咨询，提供详细的情况描述和相关证据，以便我能够为你提供更具体、更专业的法律建议。