在刑事案件中，公安机关负责人的回避由同级人民检察院检察委员会决定。这一规定旨在确保回避决定的公正性和权威性，防止因公安机关负责人与案件存在利害关系或其他可能影响公正处理的因素而导致判决结果的不公。

法律依据与详细解释

根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第三十一条的规定：“审判人员、检察人员、侦查人员的回避，应当分别由院长、检察长、公安机关负责人决定；院长的回避，由本院审判委员会决定；检察长和公安机关负责人的回避，由同级人民检察院检察委员会决定。”这一条款明确规定了公安机关负责人回避的决定主体。

回避的情形与方式

1. 回避情形：

   • 公安机关负责人若与案件有特定利害关系，如为本案的当事人或者是当事人的近亲属，或者本人或其近亲属和本案有利害关系，或者担任过本案的证人、鉴定人、辩护人、诉讼代理人，或者与本案当事人有其他关系可能影响公正处理案件的，均应当回避。

2. 回避方式：

   • 自行回避：公安机关负责人在发现自己符合回避情形时，应主动提出回避请求。
   • 申请回避：当事人、法定代理人等若认为公安机关负责人符合回避情形而未自行回避，有权向同级人民检察院提出申请回避的请求。
   • 指令回避：当同级人民检察院检察委员会发现公安机关负责人符合回避情形，而公安机关负责人未自行回避，也无相关人员申请回避时，可直接作出回避决定。

回避决定的效力与救济

• 回避决定的效力：回避决定一经作出，即产生法律效力，公安机关负责人必须履行，不得再参与本案的任何侦查活动。
• 救济机制：如果当事人或其法定代理人对驳回申请回避的决定不服，可以申请复议一次，以保障其合法权益和司法公正。

实际应用中的注意事项

在实际操作中，公安机关负责人的回避问题需要严格遵循法律规定，确保回避决定的公正性和权威性。同时，当事人和法定代理人也应充分了解并正确行使回避申请权，以维护自身的合法权益。如果遇到公安机关负责人应当回避而未回避的情况，可以向同级人民检察院提出申请，要求其作出回避决定。

希望以上解释能帮助您更好地理解刑事案件中公安机关负责人回避的决定主体及相关法律规定。如果您还有其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。