结论：在交通事故中自己承担的部分医疗费，若符合一定条件，是可以在工伤中获得赔偿的。这主要取决于交通事故的性质以及是否构成工伤。
分析：
交通事故与工伤的关系：
- 根据《工伤保险条例》的相关规定，职工在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的，应当认定为工伤。这意味着，如果交通事故发生在上下班途中，且职工不承担主要责任，那么该事故可以被认定为工伤。
医疗费的赔偿：
- 一旦交通事故被认定为工伤，职工因事故产生的医疗费（包括自己承担的部分）原则上应由工伤保险基金支付。这包括治疗工伤所需的医疗费用、康复费用等。
- 如果用人单位未依法缴纳工伤保险费，那么这些费用将由用人单位承担。
特殊情况下的赔偿：
- 如果交通事故是由第三方造成的，且职工已经从第三方获得了医疗费赔偿，那么工伤保险基金或用人单位在支付医疗费时可能会进行相应的扣减。但根据《社会保险法》的相关规定，职工因第三人的原因造成工伤，第三人不支付工伤医疗费用或者无法确定第三人的，由工伤保险基金先行支付。工伤保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。
- 在某些情况下，即使职工自己承担了部分医疗费，如果这部分费用是由于用人单位的过错（如未提供安全的工作环境、未及时组织救治等）导致的，职工也有权要求用人单位承担相应的赔偿责任。
实际操作建议：
- 职工在发生交通事故后，应及时向用人单位报告，并尽快申请工伤认定。
- 在申请工伤认定时，应提供相关的证据材料，如交通事故认定书、医疗费发票等。
- 如果职工自己承担了部分医疗费，且认为这部分费用应由工伤保险基金或用人单位承担，可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
举例：
假设某职工在上下班途中遭遇交通事故，且该事故被认定为工伤。该职工在治疗过程中自己承担了部分医疗费。在这种情况下，该职工可以向工伤保险基金申请支付这部分医疗费。如果工伤保险基金拒绝支付或支付不足，该职工可以向用人单位主张权利，或者通过法律途径解决争议。
总结与建议：
在交通事故中自己承担的部分医疗费，在符合工伤认定条件的情况下，是有可能在工伤中获得赔偿的。因此，建议职工在发生交通事故后及时申请工伤认定，并保留好相关的证据材料。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。