结论：案件被企业破产，对方已经付钱的情况下，能否撤销破产程序，需根据具体情况来判断，主要取决于破产程序的阶段以及付款的性质和目的。以下从不同角度进行分析：

1. 破产程序阶段的影响

   • 破产申请受理前：如果在企业破产申请被法院受理之前，对方已经支付了款项，且该款项足以解决企业的债务问题或达成和解协议，那么企业可以向法院申请撤回破产申请。此时，破产程序尚未正式启动，撤回申请是可行的。
   • 破产申请受理后至宣告破产前：若破产申请已被法院受理，但尚未宣告企业破产，此时对方支付款项，企业仍有可能与债权人达成和解协议，并请求法院裁定认可和解协议、终止和解程序并宣告企业破产中止。不过，这需要满足一定的条件，如债权人会议通过和解协议等。
   • 宣告破产后：一旦企业被宣告破产，破产程序即进入清算阶段。此时，即使对方支付了款项，也通常无法直接撤销破产程序。因为破产宣告具有法律效力，意味着企业的法人资格将被终止，其财产将用于清偿债务。不过，如果支付的款项能够全额清偿所有债务，且符合相关法律规定，理论上可以探讨通过特定程序（如重整或和解的后续程序，但实际操作中极为罕见）来尝试恢复企业运营或终止破产程序，但这需要法院的严格审查和批准。

2. 付款性质和目的的影响

   • 清偿债务：如果对方支付的款项是用于清偿企业的债务，且该清偿行为得到了债权人的认可或法院的裁定，那么这通常不会直接导致破产程序的撤销。然而，如果清偿后企业无其他债务或资产足以覆盖剩余债务，且符合破产法中关于终结破产程序的规定，那么破产程序可能会因此终结。
   • 和解或重整目的：如果对方支付的款项是作为和解协议或重整计划的一部分，旨在帮助企业恢复经营能力并避免破产，那么这可能成为撤销破产程序（或更准确地说，是终止破产程序并转入和解或重整程序）的依据。但这同样需要满足一系列法律条件，包括债权人会议的通过、法院的裁定等。

法律建议：

• 如果您面临这样的情况，建议首先咨询专业律师，详细了解企业破产程序的具体阶段以及对方付款的性质和目的。
• 根据律师的分析，评估是否有可能通过和解、重整或其他法律程序来撤销或终止破产程序。
• 如果决定尝试撤销或终止破产程序，务必按照法律规定的程序和要求进行操作，以确保合法性和有效性。

可能的法律后果：

• 如果未经法院批准擅自撤销或终止破产程序，可能会面临法律责任和处罚。
• 即使成功撤销或终止破产程序，也可能需要承担一定的法律后果，如清偿剩余债务、恢复企业信用等。

总之，案件被企业破产且对方已经付钱的情况下，能否撤销破产程序需根据具体情况来判断。如有需要，请直接向我咨询，我将根据您的具体情况提供详细的法律建议。