耕地被高铁第三方承包占用是否违法，需分情况讨论：
若占用行为有合法依据，则不违法
- 合法征收与补偿：高铁建设属于国家重大基础设施项目，若因建设需要占用耕地，应当依法进行征收，并给予农民合理补偿。根据《土地管理法》的相关规定，征收土地应当按照法定程序进行，包括发布征收公告、进行土地现状调查、组织听证、签订补偿安置协议等。若第三方承包占用耕地是在完成这些法定程序后进行的，且补偿到位，则该行为是合法的。
- 临时用地许可：在高铁建设过程中，有时可能需要临时占用耕地进行施工。这种情况下，建设单位应当依法申请临时用地许可，并在使用完毕后恢复土地原状。若第三方承包占用耕地是在获得临时用地许可的前提下进行的，且按照许可要求使用土地，则该行为也是合法的。
若占用行为无合法依据，则违法
- 未经批准擅自占用：若第三方承包占用耕地未经任何法定程序批准，如未取得征收决定、未签订补偿安置协议、未获得临时用地许可等，则该行为构成非法占用土地，是违法的。
- 超出批准范围或期限占用：即使第三方承包占用耕地最初获得了合法批准，但如果其在实际使用过程中超出了批准的范围或期限，也构成违法占用土地。例如，临时用地许可明确规定了使用期限和范围，但第三方却超期或超范围使用土地。
法律后果与建议：
- 法律后果：对于非法占用耕地的行为，相关责任人可能面临行政处罚，如罚款、责令退还土地、恢复土地原状等；情节严重的，还可能构成犯罪，依法追究刑事责任。
- 建议：若您发现耕地被高铁第三方承包非法占用，建议首先收集相关证据，如照片、视频、证人证言等，以证明占用行为的存在和违法性。然后，您可以向当地国土资源部门或农业部门举报该行为，要求相关部门进行调查处理。同时，您也可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如提起行政诉讼或民事诉讼等。
进一步思考：
- 在处理此类问题时，还需要考虑耕地保护政策、土地利用总体规划等因素。例如，即使占用行为在程序上合法，但如果违反了耕地保护政策或土地利用总体规划，也可能面临一定的法律风险。
- 此外，对于高铁建设等国家重大基础设施项目，政府通常会给予一定的政策支持和优惠。因此，在处理耕地占用问题时，也需要充分考虑这些因素，以寻求合法、合理、可行的解决方案。
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