结论：在第三人代土地流转者交付流转费的情况下，流转人能否向第三人主张流转费，需根据具体情况判断，主要包括第三人代付的性质、流转合同的具体约定以及相关法律规定。以下从不同角度进行分析：
一、第三人代付的性质
债务承担或债务加入：
- 如果第三人代付流转费的行为构成债务承担或债务加入，即第三人明确表示愿意承担流转人的债务，或者与流转人共同承担债务，那么流转人有权向第三人主张流转费。这种情况下，第三人成为了债务人之一，流转人可以依据相关法律规定向其追偿。
委托支付或代为履行：
- 如果第三人代付流转费是基于流转人的委托，或者作为受托人代为履行流转合同中的支付义务，那么流转人通常不能直接向第三人主张流转费，除非第三人未按照委托或合同约定履行支付义务，且流转人因此遭受了损失。在这种情况下，流转人可能需要先向原债务人（即土地流转的相对方）主张权利，再根据具体情况追究第三人的责任。
无因管理或不当得利：
- 如果第三人代付流转费的行为既不构成债务承担或债务加入，也不是基于流转人的委托或合同约定，而是出于无因管理（即没有法定或约定的义务，为避免他人利益受损失而进行管理）或不当得利（即一方没有合法根据，取得不当利益，造成他人损失）的原因，那么流转人可能需要根据具体情况向第三人主张权利或承担相应责任。但这种情况下的法律关系较为复杂，需要具体分析。
二、流转合同的具体约定
- 流转合同是确定流转双方权利义务的重要依据。如果流转合同中明确约定了流转费的支付方式、支付对象以及违约责任等条款，那么流转人应当按照合同约定向相对方主张流转费。如果第三人代付流转费的行为违反了合同约定，流转人可能需要先与相对方协商解决，或者依据合同约定追究相对方的违约责任。
- 如果流转合同中没有明确约定流转费的支付方式或支付对象，或者约定不明确，那么流转人可以根据实际情况和交易习惯向相对方或第三人主张权利。在这种情况下，流转人需要提供充分的证据证明其主张的合理性。
三、相关法律规定
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规的规定，债务人应当按照约定履行债务。如果债务人未按照约定履行债务，债权人有权要求其承担违约责任。在第三人代付流转费的情况下，如果第三人未按照约定或法律规定履行支付义务，流转人可以依据相关法律法规向其主张权利。
- 同时，如果第三人代付流转费的行为损害了流转人的合法权益，流转人也可以依据相关法律法规要求第三人承担赔偿责任。
法律建议
- 审查合同条款：流转人应仔细审查流转合同中的相关条款，明确流转费的支付方式、支付对象以及违约责任等事项。
- 收集证据：如果流转人认为第三人代付流转费的行为存在问题，应收集相关证据（如转账记录、聊天记录、合同文本等）以支持其主张。
- 咨询专业律师：由于土地流转涉及复杂的法律关系和利益纠葛，流转人在遇到相关问题时应及时咨询专业律师，以便更好地维护自身合法权益。
举例说明：假设流转合同中明确约定流转费应由土地流转的相对方直接支付给流转人，但第三人未经流转人同意擅自代付了流转费。在这种情况下，流转人仍有权向相对方主张流转费，并可以要求相对方承担违约责任。如果第三人代付流转费的行为给流转人造成了损失（如流转人因此无法及时收到流转费而产生了额外费用），流转人也可以要求第三人承担相应的赔偿责任。但具体责任承担方式需根据实际情况和法律规定进行判断。