调田协议能否超过第三轮土地承包期限，需分情况讨论：

1. 若调田协议的期限本身未超过第三轮承包期
   根据《农村土地承包法》规定，第三轮土地承包期限为30年（自1999年至2029年，部分地区可能略有差异）。若调田协议约定的期限在承包期内（例如仅调整5年），则协议合法有效，无需突破承包期限制。此时协议受法律保护，双方应按约定履行。

2. 若调田协议试图突破第三轮承包期
   若协议约定调整后的土地使用期限超过2029年（即第三轮承包期届满后），则需分情形处理：

   • 承包期内调整：在承包期内，土地承包经营权归原承包户所有，调田协议本质是土地经营权的流转（如转包、出租）。根据《民法典》第342条，流转期限不得超过承包期的剩余期限。因此，协议中超过2029年的部分无效，但不影响2029年前部分的效力。
     
   • 承包期满后调整：若涉及承包期满后的土地使用安排，需等待国家政策明确。根据中央文件，第三轮承包期满后将再延长30年（即至2059年），但具体调整需以新一轮承包合同为准。在未签订新承包合同前，任何试图预先约定超过2029年的调田协议均无法律效力。

3. 特殊情形：土地征收或政策调整
   若调田期间土地被征收，或遇国家政策调整（如退耕还林、土地整理等），协议可能因“情势变更”或公共利益需要被终止或修改。此时需按《民法典》第533条处理，双方可协商变更或解除协议。

建议：

• 签订调田协议时，明确约定期限不超过第三轮承包期剩余年限（如2029年），避免无效条款；
  
• 若涉及长期调整，可约定“承包期满后按国家政策重新协商”的弹性条款；
  
• 协议需经发包方（村集体）备案，确保程序合法。
  

如有具体协议条款或地方政策疑问，可进一步向我咨询。