针对您提出的问题，即公司在申报工伤时发现责任认定书时间和入院记录不符的情况，以下是我为您提供的详细处理建议：

首先，核实信息差异：

• 您需要仔细核对责任认定书和入院记录上的时间信息，确认两者之间的差异具体是什么，是日期错误、时间点不符还是其他类型的差异。
• 同时，检查是否有其他相关信息（如事故描述、伤情记录等）也存在不一致或模糊的情况。

接下来，收集证据材料：

• 收集与工伤事故相关的所有证据材料，包括但不限于事故现场照片、视频、目击者证言、工作记录、考勤记录等。
• 这些证据材料将有助于证明工伤事故的真实性和发生时间，从而支持您的工伤认定申请。

然后，与相关部门沟通：

• 与医院沟通：联系入院记录的出具医院，说明情况并请求医院出具书面证明或更正入院记录中的时间信息（如果确实存在错误）。
• 与劳动保障部门沟通：向负责工伤认定的劳动保障部门说明责任认定书和入院记录时间不符的情况，并提交您收集的证据材料。劳动保障部门将根据实际情况进行调查和核实。

在沟通过程中，强调真实性和合理性：

• 向相关部门强调工伤事故的真实性和发生时间的合理性，解释责任认定书和入院记录时间不符的可能原因（如记录错误、时间差等）。
• 提供充分的证据材料来支持您的观点，以增加工伤认定申请的成功率。

最后，遵循法律程序：

• 如果劳动保障部门对工伤认定申请存在疑问或需要进一步调查，您需要积极配合并提供必要的协助。
• 如果工伤认定申请被驳回或存在争议，您可以考虑通过法律途径解决，如申请行政复议或提起行政诉讼等。

额外建议：

• 在处理此类问题时，建议咨询专业的法律人士或劳动保障顾问，以获取更具体和专业的指导。
• 同时，确保公司在未来的工伤认定申请中更加谨慎和准确，避免类似问题的再次发生。

希望以上建议能对您有所帮助。如果您在处理过程中遇到任何困难或疑问，请随时向我咨询。