合同有机构认定的，按合同内容打官司并不意味着一定不会输。诉讼的结果受多种因素影响，以下从不同角度为你详细分析：
一、合同认定的性质与效力
机构认定的性质：
- 合同经过机构认定，通常意味着该合同在形式上或内容上符合了一定的标准或要求。然而，这种认定并不等同于法院的最终判决，也不保证合同在法律上一定有效或可执行。
认定的效力：
- 机构认定可能作为证据在诉讼中使用，但其证明力需由法院根据具体情况进行判断。法院会综合考虑合同的内容、签订过程、当事人的真实意思表示等因素，来判定合同的效力。
二、影响诉讼结果的因素
合同内容的合法性：
- 即使合同经过机构认定，如果其内容违反了法律、行政法规的强制性规定，或者违背了公序良俗，那么该合同可能被认定为无效。在这种情况下，按照合同内容打官司，很可能会输。
当事人的真实意思表示：
- 法院在审理合同纠纷时，会关注当事人的真实意思表示。如果合同是在欺诈、胁迫、乘人之危等情况下签订的，或者当事人对合同内容存在重大误解，那么合同可能被撤销或变更。这也会影响诉讼的结果。
证据的充分性与证明力：
- 在诉讼中，证据的充分性和证明力至关重要。即使合同经过机构认定，如果当事人无法提供充分的证据来支持自己的主张，或者提供的证据证明力不足，那么也可能面临败诉的风险。
法律适用与解释：
- 不同的法律条款和司法解释可能对同一合同纠纷产生不同的影响。法院在审理案件时，会根据具体的法律事实和法律规定来适用和解释法律。因此，即使合同内容明确，如果法律适用或解释上存在争议，也可能影响诉讼的结果。
三、建议与策略
全面审查合同：
- 在打官司前，应全面审查合同的内容、签订过程以及相关法律法规，确保合同在法律上有效且可执行。
收集并固定证据：
- 收集并固定与合同纠纷相关的所有证据，包括合同文本、签订过程中的往来函件、付款凭证等。这些证据将在诉讼中发挥关键作用。
寻求专业法律帮助：
- 如果你对合同纠纷的法律问题存在疑问或不确定，建议寻求专业律师的帮助。律师可以为你提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助你更好地维护自己的合法权益。
如果有任何具体的合同纠纷问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律建议。