结论：车主是否会受影响取决于事故责任划分、保险条款约定及车主后续行为，具体分析如下：

1. 若事故责任在对方且保险公司赔付合理
   若事故责任完全由对方承担，且保险公司提出的1000元赔付金额符合保险合同约定及实际损失（如车辆维修费、医疗费等），车主拒绝赔付可能导致对方通过法律途径追偿。此时车主可能面临：

   • 对方起诉要求车主或其保险公司支付赔偿金；
     
   • 若车主未及时处理，可能被法院强制执行财产；
     
   • 车主的保险理赔记录可能受影响（如影响下一年保费折扣）。

2. 若事故责任在车主或赔付金额不合理
   若车主对事故责任有异议（如认为对方也应承担部分责任），或认为1000元赔付远低于实际损失（如维修费需5000元），车主拒绝赔付是合理的。此时需注意：

   • 车主应保留证据（如事故现场照片、维修清单、医疗发票等），证明实际损失高于赔付金额；
     
   • 若对方起诉，车主可在诉讼中主张调整赔付金额；
     
   • 若车主未购买足够保险（如第三者责任险保额不足），超出保险部分需车主自行承担。

3. 若车主拒绝赔付后未采取进一步行动
   若车主仅拒绝赔付但未与对方或保险公司沟通，可能导致：

   • 对方认为车主恶意拒赔，加速法律程序；
     
   • 保险公司可能以“车主未配合理赔”为由拒绝后续赔付；
     
   • 车主的信用记录（如涉及执行）可能受损。

建议：

• 车主应首先核对保险合同条款，确认赔付范围及金额是否合理；
  
• 若对责任或金额有异议，及时与保险公司、对方协商，或通过交警部门调解；
  
• 若协商无果，建议通过法律途径解决（如诉讼或仲裁），避免单方面拒绝赔付引发更大风险。
  

如有具体案件细节（如事故责任认定书、保险条款等），可进一步向我咨询，我会结合证据提供更精准的分析。