结论：涉及房屋产权纠纷强占店铺超一年的第三方，无论其是否为本地户籍，都可以在店铺所在地（即侵权行为地或不动产所在地）的法院提起诉讼。

详细分析：

1. 管辖法院的确定原则：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，民事诉讼通常由被告住所地人民法院管辖。然而，在涉及不动产的纠纷中，法律有特别规定。
   • 《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条规定：“下列案件，由本条规定的人民法院专属管辖：（一）因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院管辖；……”。这一规定明确了不动产纠纷的专属管辖原则，即不动产纠纷应由不动产所在地的人民法院管辖。

2. 不动产纠纷的专属管辖：

   • 在您所描述的情况中，房屋产权纠纷显然属于不动产纠纷的范畴。因此，无论第三方是否为本地户籍，都不影响不动产所在地法院对本案的管辖权。
   • 第三方强占店铺的行为，构成了对房屋产权的侵害，属于侵权行为。根据《中华人民共和国民事诉讼法》中关于侵权行为地管辖的规定，侵权行为地（即店铺所在地）的法院也有权管辖此类纠纷。

3. 诉讼准备与建议：

   • 在提起诉讼前，您应收集并整理好相关证据，如房屋产权证明、租赁合同（如有）、强占行为的证据（如照片、视频、证人证言等）等。
   • 考虑到房屋产权纠纷可能涉及复杂的法律关系和事实认定，建议您在提起诉讼前咨询专业律师，以便更好地制定诉讼策略和准备诉讼材料。
   • 在诉讼过程中，您应积极配合法院的调查和审理工作，如实陈述事实，提供证据，以维护自己的合法权益。

特殊情况说明：

• 如果第三方在强占店铺的同时，还实施了其他违法行为（如破坏财物、威胁人身安全等），您还可以考虑向公安机关报案，追究其刑事责任。
• 如果房屋产权存在争议或纠纷涉及多方当事人，法院可能会根据案件的具体情况，决定是否追加其他当事人参加诉讼。

后续行动建议：

• 鉴于房屋产权纠纷的复杂性和专业性，我建议您尽快咨询专业律师，以便更全面地了解自己的法律权益和诉讼风险。
• 在律师的指导下，您可以更好地准备诉讼材料，制定诉讼策略，并积极参与诉讼过程，以维护自己的合法权益。

如有任何进一步的问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。