认定合同违约金，既非单纯以合同总价，也非单纯以已付款为标准，而是需根据合同的具体约定以及实际损失情况来综合判断。以下从不同角度为你详细分析：
合同约定优先：
- 在合同纠纷中，合同是双方意思自治的体现，具有法律约束力。因此，如果合同中明确约定了违约金的计算方式，无论是基于合同总价还是已付款，都应首先遵循合同约定。例如，合同可能规定“若一方违约，需支付合同总价10%的违约金”或“若一方违约，需退还已付款并支付已付款20%的违约金”。
实际损失考量：
- 如果合同中没有明确约定违约金的计算方式，或者约定的违约金过高或过低，法院或仲裁机构在裁决时，会考虑违约行为给对方造成的实际损失。这包括直接损失和间接损失，如因违约导致的额外费用支出、利润损失等。在这种情况下，违约金的数额可能会根据实际损失情况进行调整，以确保公平合理。
违约金与定金的选择：
- 在合同中，有时既约定了违约金，又约定了定金。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人既约定违约金，又约定定金的，一方违约时，对方可以选择适用违约金或者定金条款。这意味着，在实际操作中，守约方有权选择对自己最有利的方式来追究违约方的责任。
违约金调整机制：
- 如果约定的违约金过分高于或低于实际损失，当事人可以请求法院或仲裁机构予以适当减少或增加。这体现了法律对违约金数额的公平调整机制，旨在防止违约金成为一方谋取不正当利益的工具。
举个例子：假设甲乙双方签订了一份买卖合同，合同总价为100万元，约定若一方违约需支付合同总价20%的违约金。后因甲方违约，乙方实际损失为15万元。在此情况下，如果乙方选择适用违约金条款，甲方需支付20万元违约金；但如果乙方认为违约金过高，可以请求法院或仲裁机构予以减少，最终可能根据实际损失情况判决甲方支付15万元或略高于15万元的违约金。
建议：在签订合同时，双方应明确约定违约金的计算方式和数额，以避免后续纠纷。同时，在发生违约行为时，守约方应及时收集证据，证明自己的实际损失情况，以便在追究违约责任时能够得到合理的赔偿。如果你在合同纠纷中遇到具体问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。