有独立请求权的第三人（有独三）能否提出管辖权异议，需分情况讨论：

1. 若被原告在起诉状中明确列为有独三，且其基于独立请求权参加诉讼：

   • 有权提出管辖权异议。此时，有独三虽以第三人身份参与诉讼，但并未明确表示接受受诉法院的管辖，因此有权对管辖权提出质疑。例如，甲公司起诉乙公司，丙公司作为有独三主张对诉讼标的有独立请求权，若丙公司认为受诉法院无管辖权，可提出异议。

2. 若主动参加诉讼或被法院通知参加诉讼：

   • 无权提出管辖权异议。主动参加诉讼视为接受受诉法院的管辖，无权再质疑；被法院通知参加诉讼时，若选择以有独三身份参与，亦视为接受管辖。若对管辖权有异议，应选择以原告身份向其他有管辖权的法院另行起诉。例如，丙公司主动加入甲公司与乙公司的诉讼，或丙公司被法院通知参加诉讼并选择以有独三身份参与，均不得再提管辖权异议。

法律依据与解析：

• 《最高人民法院关于第三人能否对管辖权提出异议问题的批复》【法[经]复﹝1990﹞9号】明确规定：有独三主动参加他人已开始的诉讼，应视为承认和接受了受诉法院的管辖，不发生对管辖权提出异议的问题；若受诉法院依职权通知其参加诉讼，其有权选择以有独三身份参与或以原告身份向其他有管辖权的法院另行起诉。
• 《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第八十二条进一步明确了无独立请求权的第三人在诉讼中的权利限制，虽未直接针对有独三，但体现了法院对第三人参加诉讼时管辖权问题的审慎态度。

实务建议：

• 明确诉讼地位：有独三在参加诉讼前，应明确自身诉讼地位及权利义务，避免因误解导致程序瑕疵。
• 及时提出异议：若认为受诉法院无管辖权，且符合提出异议的条件，应在提交答辩状期间内及时提出，避免丧失权利。
• 准备充分证据：提出管辖权异议时，应提供充分的证据证明异议理由的合理性，如合同履行地、被告住所地等管辖规则的相关证据。
• 寻求专业帮助：复杂案件中，建议直接向我咨询，以确保异议申请的合法性和有效性，避免因程序错误导致不利后果。

总结：有独三能否提出管辖权异议，取决于其参加诉讼的具体方式和情况。在特定条件下，如被原告明确列为有独三且基于独立请求权参加诉讼时，有权提出异议；但在主动参加诉讼或被法院通知参加诉讼的情况下，则无权提出。因此，有独三在参加诉讼前，应仔细研究相关法律法规，明确自身权利义务，避免因程序瑕疵导致不利后果。