市场监管部门对商家使用不合格电子秤实施扣押，主要依据《中华人民共和国计量法》及其实施细则、《中华人民共和国产品质量法》以及《中华人民共和国行政强制法》的相关规定。具体分析如下：

1. 《中华人民共和国计量法》及其实施细则
   根据《计量法》第二十七条及《计量法实施细则》第四十七条，市场监管部门有权对使用不合格计量器具（如电子秤）或破坏计量器具准确度的行为进行查处。若商家使用的电子秤未经检定、超过检定周期或检定不合格，市场监管部门可依法扣押该器具，并处以罚款。例如，商家故意调整电子秤参数导致短斤缺两，即属于破坏准确度的违法行为。

2. 《中华人民共和国产品质量法》
   若电子秤本身存在质量问题（如不符合国家标准），市场监管部门可依据《产品质量法》第十八条，对涉嫌违反产品质量安全标准的产品进行查封或扣押。例如，电子秤的制造许可证已过期、未标注强制认证标志（如3C认证），或经检测存在计量误差超标等缺陷，均可能触发扣押措施。

3. 《中华人民共和国行政强制法》
   扣押属于行政强制措施，需严格遵循《行政强制法》的程序要求。市场监管部门在实施扣押时，必须满足以下条件：

   • 证据充分：需有初步证据证明电子秤不合格或存在违法行为；
     
   • 程序合法：须出具书面扣押决定书及清单，并告知当事人救济途径；
     
   • 期限限制：扣押期限一般不超过30日，特殊情况经批准可延长，但需在法定期限内作出处理决定。

实务建议：
若商家被扣押电子秤，可要求市场监管部门出具扣押决定书及检测报告，确认扣押依据是否充分。若对扣押行为有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体法律程序及应对策略。