针对借用建筑公司资质施工后因提成问题发生纠纷的处理方式，核心结论如下：需根据纠纷性质选择协商、行政投诉或诉讼途径解决，同时需注意资质借用行为的违法性及合同效力问题。以下是具体分析：
1. 纠纷性质认定与处理途径
- 合同纠纷：若双方签订了书面或口头协议明确提成比例及支付方式，可依据《民法典》合同编主张权利。但需注意，借用资质的行为本身违反《建筑法》第二十六条（禁止无资质或超越资质承揽工程），合同可能因违反法律强制性规定被认定无效。此时，提成条款虽无效，但已完成的工程量可参照合同约定折价补偿。
- 侵权纠纷：若建筑公司恶意扣留提成，可主张其构成不当得利或侵权，要求返还应得利益。需提供工程量证明、提成计算依据等证据。
2. 行政投诉与处罚风险
- 资质借用违法性：根据《建筑法》第六十五条，出借资质的建筑公司可能面临责令改正、没收违法所得、罚款（工程合同价款2%-4%）的处罚，情节严重的可吊销资质证书。
- 举报途径：可向当地住房和城乡建设部门举报建筑公司违法出借资质的行为，通过行政压力推动纠纷解决，但需注意举报可能引发双方关系进一步恶化。
3. 诉讼策略与证据准备
- 诉讼主体：以实际施工人身份起诉建筑公司，要求支付工程款及提成。若建筑公司拒付，可申请法院委托鉴定机构对工程量及造价进行评估。
- 关键证据：
- 证明实际施工的证据（如施工日志、材料采购单、工人工资发放记录）；
- 证明提成约定的证据（如聊天记录、录音、证人证言）；
- 建筑公司认可工程量的证据（如验收报告、结算单）。
4. 风险提示与合规建议
- 合同无效风险：即使胜诉，法院可能仅支持“折价补偿”而非全额提成，需做好心理预期。
- 行政处罚连带风险：若建筑公司因资质借用被处罚，实际施工人可能因参与违法行为面临罚款或信用惩戒。
- 合规建议：未来应避免借用资质，可通过联营合作、内部承包等合法方式参与工程，并签订书面合同明确权责。
行动建议：
- 优先与建筑公司协商，明确提成计算方式及支付时间；
- 协商无果时，收集证据向住建部门投诉或直接起诉；
- 咨询专业律师评估证据充分性及诉讼风险，制定个性化方案。
如有进一步证据或细节需要分析，可直接向我提供材料，我会结合具体情形为您细化策略。