在处理公证书（这里主要指公证遗嘱）与遗嘱（如自书遗嘱）发生冲突的问题时，我们需要依据一系列明确的法律原则和规定来确保遗嘱的真实性与合法性得到最大程度的尊重和执行。以下是对这一问题的详细解答：
一、公证遗嘱的优先效力
首先，我们要明确的是，在一般情况下，公证遗嘱因其经过国家公证机关的严格审查，具有较高的公信力和法律效力，因此在与自书遗嘱等非公证遗嘱发生冲突时，原则上以公证遗嘱为准。这一原则体现了对公证程序严谨性和遗嘱真实性的尊重。
二、时间先后的考量
然而，法律也并非一成不变。在《中华人民共和国民法典》中，虽然删除了原《继承法》中关于公证遗嘱绝对优先的规定，但对于非公证遗嘱（如自书遗嘱），则以最后订立的遗嘱为准。这体现了对遗嘱人最终意愿的尊重。因此，如果自书遗嘱是在公证遗嘱之后订立的，且内容相抵触，那么自书遗嘱在符合法律要求的情况下，有可能被视为有效。
三、特殊情况的考量
除了时间先后，我们还需要考虑一些特殊情况：
遗嘱人的行为：如果遗嘱人在立公证遗嘱后实施了与遗嘱内容相反的民事法律行为，这可以被视为对公证遗嘱相关内容的撤回。在这种情况下，自书遗嘱可能被视为遗嘱人的最终意愿。
公证遗嘱的瑕疵或撤销：公证遗嘱并非不可动摇。如果公证遗嘱存在违反法定程序、公证员过错等导致无效或被撤销的情形，那么自书遗嘱在符合法律要求的情况下，可能被认定为有效。
自书遗嘱的真实性：如果自书遗嘱能够充分证明是遗嘱人在意识清醒、思维清晰情况下的最终真实意思表示，且符合法律形式和内容要求，那么它也有可能被优先执行。
四、解决方式
当公证书与遗嘱发生冲突时，我们可以采取以下方式来解决：
协商解决：继承人之间应首先尝试通过协商来解决争议。这有助于维护家庭和睦，且能够快捷、简便地解决问题。
调解处理：如果协商无果，可以请求居委会、民事调解委员会或人民调解委员会等中立第三方进行调解。他们将协助各方进行沟通，以达成和解。
诉讼解决：当协商和调解均无法解决问题时，可以通过向法院提起诉讼来解决争议。法院将根据双方提供的证据，对遗嘱的效力、内容、执行等问题进行审查和判断，并依法作出判决。
申请复查：如果对遗嘱公证书的真实性存在质疑，还可以通过法定程序向公证机构申请复查，审查公证过程是否符合相关规范。
五、总结
综上所述，处理公证书与遗嘱冲突时，我们需要综合考虑遗嘱的订立时间、形式、内容以及遗嘱人的真实意图等因素。在尊重遗嘱人最终意愿的同时，也要确保遗嘱的合法性和真实性得到充分验证。通过协商、调解、诉讼或申请复查等严谨的法律分析和判断方式，我们可以确保遗产的公正分配和遗嘱的有效执行。