在对方保管证据的情况下，处理方式需结合证据类型、案件阶段及法律规定综合判断，以下是具体分析：

1. 申请法院调取证据
   若证据由对方或第三方保管且您无法自行获取（如医院病历、银行流水、监控录像等），可在诉讼中向法院提交《调查取证申请书》，明确证据名称、保管方、与案件关联性及无法取得的原因。法院审查后若认为必要，会向保管方发出协助调查函或直接调取。注意：需在举证期限内提出申请，逾期可能被驳回。

2. 通过律师调查令获取
   在部分案件（如民事诉讼）中，律师可持法院签发的调查令向保管方调取证据。需提前与法院沟通确认管辖范围及证据类型是否符合调查令适用条件（如涉及国家秘密、个人隐私的证据可能受限）。

3. 协商或公证取证

   • 协商取证：若对方配合，可签订书面协议明确证据交接方式、时间及用途，避免后续争议。
     
   • 公证取证：对易灭失或篡改的证据（如聊天记录、网页截图），可申请公证处公证固定证据效力。公证费用由申请方承担，但可增强证据证明力。

4. 对方拒不提交的应对
   若对方明确拒绝提交且证据对案件关键事实认定至关重要，可主张适用《最高人民法院关于民事诉讼证据的若干规定》第95条，推定您主张的事实成立（如对方持有账簿却拒不提供，法院可能直接认定您主张的欠款金额）。

5. 特殊证据的处理

   • 电子数据：若证据为对方控制的电子邮件、云存储文件等，可申请法院责令对方提交或委托第三方技术机构恢复数据。
     
   • 物证：如对方保管的涉案物品，可申请法院先予执行或财产保全，防止证据转移或毁损。

行动建议：

• 立即整理证据清单，标注保管方、证据形式及与案件的关联性；
  
• 根据案件阶段（诉前/诉中）选择合适取证方式，优先通过法院调取；
  
• 保留与对方沟通取证的书面记录（如微信、邮件），作为辅助证据。
  

如有具体证据类型或案件背景需进一步分析，可直接向我说明细节。