法院大概率会判决小三返还已收取的款项，但具体返还金额需结合实际情况判断。以下从不同角度详细分析：

从夫妻共同财产角度分析

1. 法律依据 根据《中华人民共和国民法典》第一千零六十二条规定，夫妻在婚姻关系存续期间所得的工资、奖金、劳务报酬，生产、经营、投资的收益等财产，为夫妻的共同财产，归夫妻共同所有，双方有平等的处理权。男方未经原配同意，擅自将夫妻共同财产支付给小三用于生孩子等费用，属于无权处分行为。
2. 法院判决倾向 原配作为夫妻共同财产的合法共有人，有权要求小三返还已收取的款项。法院在审理此类案件时，通常会认定男方的支付行为侵犯了原配对夫妻共同财产的平等处理权，从而支持原配的诉求，判决小三返还相应钱款。

从返还金额角度分析

1. 全额返还情况 如果男方提前支付的款项全部属于夫妻共同财产，且没有其他特殊情形，法院一般会判决小三将已收取的全部款项返还给原配。例如，男方用家庭积蓄提前支付了五万元给小三，那么小三应将这五万元全额返还。
2. 部分返还情况
   • 男方个人财产部分：若男方支付的款项中有一部分属于其个人财产（如婚前个人积蓄、个人获得的赔偿等），那么这部分款项可能不会被判决返还。但在实践中，要区分夫妻共同财产和男方个人财产往往比较复杂，需要男方提供充分的证据证明款项的来源。
   • 小三实际支出：如果小三能够证明部分款项已经用于与孩子相关的合理支出（如产检费用、生产费用、孩子的生活必需品费用等），法院可能会酌情扣除这部分合理支出后，判决小三返还剩余款项。不过，小三需要提供充分的证据证明这些支出的合理性和必要性。

从证据角度分析

1. 原配的举证责任 原配需要提供证据证明男方支付款项给小三的事实，以及这些款项属于夫妻共同财产。例如，银行转账记录、聊天记录、证人证言等，都可以作为证明男方支付行为的证据。同时，原配还需要提供证据证明这些财产是在婚姻关系存续期间取得的，属于夫妻共同财产。
2. 小三的抗辩证据 小三如果主张部分款项不应返还，需要提供相应的证据支持自己的主张。如前所述，若主张部分款项用于孩子合理支出，需提供发票、收据等证据；若主张部分款项属于男方个人财产，也需提供证据证明款项来源。

建议：原配在起诉前要尽可能收集相关证据，以支持自己的诉求。如果你还有其他关于此类法律问题的疑问，可以直接向我咨询。