若公司公租房的租金本应由公司收取，但员工却进行了收款，这可能涉及违规操作，甚至可能构成违法，具体需分情况讨论：

1. 员工未经授权收款

   • 如果员工未经公司明确授权，擅自收取公租房租金，这属于无权代理行为。公司有权要求员工将收取的租金全额返还，并可能对员工进行内部纪律处分。
   • 若员工拒不返还，公司可以通过法律途径，如提起民事诉讼，要求员工返还租金并赔偿因此造成的损失。

2. 员工与租户恶意串通

   • 如果员工与租户恶意串通，以低于市场价或公司规定的价格收取租金，从中谋取私利，这不仅损害了公司的利益，还可能构成职务侵占或贪污等犯罪行为。
   • 公司应立即报警，并配合警方调查。一旦查实，员工将面临刑事责任的追究，同时公司也有权要求员工和租户共同赔偿损失。

3. 公司管理漏洞导致

   • 如果是因为公司内部管理存在漏洞，如财务制度不健全、审批流程不规范等，导致员工有机会收款，公司应首先进行内部整改，完善相关制度。
   • 对于已经发生的收款行为，公司应根据实际情况，与员工和租户进行协商，妥善处理租金返还和赔偿事宜。若协商无果，公司可通过法律途径解决。

建议措施：

• 公司应立即对公租房的租金收取情况进行全面清查，核实每一笔租金的收取情况。
• 对于发现的违规收款行为，公司应迅速采取措施，要求员工返还租金，并根据情况决定是否进行内部纪律处分或报警处理。
• 公司应加强内部管理，完善财务制度和审批流程，防止类似事件再次发生。

后续法律关注：

• 公司应密切关注相关法律法规的变化，确保公租房的管理和租金收取符合法律要求。
• 若涉及法律纠纷或诉讼，公司应及时咨询专业律师，制定合适的法律策略，以维护公司的合法权益。

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