自然资源违法占地因争议不予立案的依据主要涉及立案条件、争议性质及证据要求等方面。以下是对此问题的详细分析：

1. 立案条件不满足：

   • 根据《中华人民共和国土地管理法》及相关实施条例，自然资源主管部门（原国土资源部门）在接到违法占地举报或发现违法占地行为后，会进行初步调查核实。若调查结果显示违法占地行为不成立，或者证据不足以证明存在违法占地行为，则可能因不满足立案条件而不予立案。
   • 例如，若举报人提供的线索模糊不清，或经初步调查后发现所举报的土地使用行为并未违反相关法律法规，自然资源主管部门可能会决定不予立案。

2. 争议性质导致：

   • 在违法占地案件中，若存在土地权属争议，且该争议尚未得到解决，自然资源主管部门可能会因争议性质而暂缓或不予立案。这是因为土地权属争议往往涉及复杂的法律关系和历史遗留问题，需要先行解决权属争议后，才能进一步判断是否存在违法占地行为。
   • 例如，若两块土地之间存在权属纠纷，双方均主张对同一块土地拥有使用权，且该纠纷尚未通过法律途径解决，则自然资源主管部门在接到关于其中一方违法占地的举报时，可能会因争议性质而决定不予立案，待权属争议解决后再行处理。

3. 证据不足或存在瑕疵：

   • 立案需要充分的证据支持。若举报人提供的证据不足以证明违法占地行为的存在，或者证据存在瑕疵（如证据来源不明、证据内容不真实等），自然资源主管部门可能会因证据不足或存在瑕疵而决定不予立案。
   • 例如，若举报人仅提供了一张模糊的照片作为证据，且该照片无法清晰显示违法占地行为的具体情况，或者照片中的场景与举报内容不符，则自然资源主管部门可能会认为证据不足而决定不予立案。

法律建议：

• 对于举报人而言，若认为自然资源主管部门不予立案的决定不当，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，以维护自己的合法权益。
• 在举报违法占地行为时，应尽可能提供充分、真实、有效的证据，以支持自己的举报内容。同时，也应了解并遵守相关法律法规和程序要求，以确保举报行为的合法性和有效性。

可能后果：

• 若自然资源主管部门因争议性质或证据不足等原因决定不予立案，而举报人认为该决定不当并提起行政复议或行政诉讼，则可能引发一系列的法律程序和争议解决过程。这可能会耗费举报人大量的时间和精力，并可能对其造成一定的经济损失。因此，在举报前应充分评估风险并做好准备。

如有任何关于自然资源违法占地或相关争议解决的法律问题，可以直接向我咨询。