针对您提出的“医院违法被注销，员工怎么赔偿”的问题，这实际上涉及到医院因违法行为被注销后，其与员工之间劳动关系的终止及赔偿事宜。以下是我为您提供的详细解答：
一、医院违法被注销与员工赔偿的关系
当医院因违法行为被注销时，其与员工之间的劳动合同将因医院主体资格的消灭而自动终止。但终止劳动合同并不意味着员工无法获得赔偿，关键在于医院终止劳动合同的行为是否合法，以及员工是否因此遭受了损失。
二、违法注销下员工的赔偿权利
若医院违法注销导致劳动合同非法终止：
- 在这种情况下，医院的行为构成违法终止劳动合同，员工有权要求医院支付赔偿金。
- 赔偿金的计算标准通常为员工在医院工作年限每满一年支付两个月工资（即经济补偿标准的二倍）。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付一个月工资的经济补偿的两倍作为赔偿金。月工资指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
若医院注销前已存在违法行为，且该行为与员工被辞退或劳动合同终止有直接关联：
- 员工同样可以主张违法终止劳动合同的赔偿金，计算方式同上。
- 此外，如果员工因医院的违法行为遭受了其他损失（如未支付的工资、奖金、福利等），也有权要求医院进行赔偿。
三、特殊情况下的赔偿考虑
- 医疗期内的员工：如果员工在医疗期内被医院违法注销导致劳动合同终止，除了上述赔偿金外，医院可能还需按当地规定支付医疗补助费。
- 未签订书面劳动合同的员工：如果医院自用工之日起超过一个月不满一年未与员工签订书面劳动合同，且在此期间医院被违法注销，员工有权要求医院支付未签订合同期间的双倍工资作为补偿（但需注意，这一权利可能因医院注销而受到一定限制，具体需根据当地法律法规判断）。
四、维权途径与建议
- 收集证据：员工应首先收集与医院存在劳动关系、医院违法注销、以及自身因此遭受损失的相关证据（如劳动合同、工资单、辞退通知、医院注销公告等）。
- 协商解决：在证据充分的情况下，员工可以尝试与医院（或其清算组、接管单位等）协商解决赔偿问题。
- 申请仲裁：如果协商不成，员工可以向当地劳动争议仲裁机构申请仲裁，要求医院支付赔偿金及其他相关损失。
- 提起诉讼：对仲裁结果不满意的，员工可以向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。
五、注意事项
- 由于医院被注销可能涉及复杂的法律程序和清算事宜，员工在维权过程中应密切关注医院的清算进展，确保自己的赔偿权利得到及时保障。
- 如果医院注销后已无财产可供执行，员工可能需要考虑通过其他途径（如向医院股东、实际控制人等追偿）来维护自己的权益。
综上所述，医院违法被注销后，员工有权根据具体情况要求医院支付赔偿金及其他相关损失。在维权过程中，员工应充分了解自己的权益和可能的赔偿情形，并采取适当的维权措施。