结论：强拆程序违法但不撤销的情况下，被拆迁人确实有权申请国家赔偿，以弥补因违法行为造成的合法权益损害。以下是对此问题的详细解析：
一、法律依据
根据《中华人民共和国国家赔偿法》第二条的规定，国家机关和国家机关工作人员在行使职权过程中，若侵犯公民、法人和其他组织的合法权益并造成损害，受害人有权依法取得国家赔偿。违法强拆行为明显属于此类情形，因此被拆迁人有权申请国家赔偿。
二、申请条件
- 强拆行为违法：这是申请国家赔偿的前提条件。强拆行为必须被确认违法，这通常需要通过行政诉讼或行政复议等程序来实现。
- 合法权益受损：被拆迁人需要证明其合法权益因强拆行为而受到了损害。这包括房屋本身的价值损失、室内物品及财产损失、搬迁与临时安置费用等。
- 因果关系：被拆迁人还需证明其合法权益的损害与强拆行为的违法性之间存在因果关系。
三、赔偿范围与标准
- 房屋价值损失：通常参照就近区位类似房地产的市场价格进行评估确定。这是赔偿的主要部分，旨在弥补被拆迁人因房屋被拆而遭受的直接经济损失。
- 室内物品及财产损失：被拆迁人需承担举证责任，提供购买发票、照片、视频等证据来证明其室内物品及财产的损失情况。若因行政机关违反正当程序导致难以举证，法院可依法认定损失金额。
- 搬迁与临时安置费用：因强拆导致的合理搬迁和临时安置费用也属于赔偿范围。这些费用是因强拆行为而直接产生的，因此应由赔偿义务机关承担。
四、申请流程与步骤
提出申请：
- 对象：赔偿请求人应首先向实施强拆行为的行政机关（即赔偿义务机关）提出赔偿申请。
- 形式与内容：提交书面申请书，详细载明受害人的基本信息、具体赔偿要求、事实根据和理由。
赔偿义务机关处理：
- 时限：赔偿义务机关需在收到申请之日起两个月内作出是否赔偿的决定。
- 程序：应充分听取赔偿请求人的意见，并可协商赔偿方式、项目和数额。
- 决定形式：若决定赔偿，需制作赔偿决定书并送达；若不予赔偿，需书面通知并说明理由。
复议或诉讼：
- 期限：若赔偿义务机关未在规定期限内作出决定，或赔偿请求人对决定有异议，可在三个月内向人民法院提起诉讼。
- 程序：在复议或诉讼过程中，赔偿请求人需进一步提供证据支持其赔偿请求。
五、实际操作建议
- 准备充分证据：在申请赔偿前，收集并整理好所有能证明权益受损和损失情况的证据材料，如强拆现场的照片、视频、证人证言、购买发票等。
- 及时提出申请：注意申请时效，确保在法定期限内提出赔偿申请，以免丧失申请权利。
- 积极参与协商：与赔偿义务机关保持沟通，积极参与赔偿方式和数额的协商过程，争取达成满意的赔偿协议。
- 寻求法律帮助：若对赔偿决定有异议或遇到复杂情况，建议及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见和帮助。
总结：强拆程序违法但不撤销的情况下，被拆迁人有权依据《中华人民共和国国家赔偿法》申请国家赔偿。通过遵循正确的申请流程和提供充分的证据材料，被拆迁人可以有效地维护自己的合法权益并获得应有的赔偿。如果你在此过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。