学校加盖厂房是否违法，不能一概而论，需要结合具体情况来判断。以下从几个关键角度进行分析：

1. 规划与用地性质：

   • 学校作为教育机构，其土地使用通常有明确的规划用途，如教育用地。若加盖厂房改变了土地用途，且未经相关部门（如规划、国土部门）的批准，则可能构成违法建设。
   • 即便土地用途允许建设，但加盖厂房的具体规划（如建筑高度、面积、位置等）也需符合当地的城市规划要求，未经规划许可擅自建设同样违法。

2. 建设许可：

   • 任何建设活动，包括加盖厂房，通常都需要取得相应的建设许可，如施工许可证。未取得许可擅自施工，属于违法行为。
   • 此外，如果加盖的厂房涉及消防、环保等特殊要求，还需取得相应的专项审批。

3. 产权与使用权：

   • 学校需确认其对加盖厂房所在土地的使用权是否合法有效，以及是否有权在该土地上进行建设。
   • 如果学校是通过租赁等方式获得土地使用权，还需检查租赁合同中是否允许进行建设活动，以及是否取得了出租方的同意。

4. 相邻关系与公共利益：

   • 加盖厂房还需考虑对周边环境、相邻建筑的影响，以及是否符合公共利益。例如，不得影响周边居民的采光、通风等权益。
   • 如果加盖厂房导致安全隐患或环境污染等问题，也可能构成违法。

法律后果：

• 如果学校加盖厂房的行为被认定为违法，可能面临责令停止建设、限期拆除、罚款等行政处罚。
• 在极端情况下，如果违法建设行为严重损害公共利益或他人合法权益，还可能承担刑事责任。

建议：

• 学校在加盖厂房前，应首先咨询当地规划、国土、建设等部门，了解相关法律法规和政策要求，确保建设活动的合法性。
• 如有必要，可聘请专业律师或法律顾问进行法律风险评估和合规审查，以降低法律风险。

如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。