结论：两人合伙公司中，法人（这里假设法人即指担任法定代表人的合伙人）私自转账的行为是否违法，需结合具体情况判断，但在多数情况下，未经其他合伙人同意私自转账可能构成违约、侵权甚至犯罪。

一、法律层面的详细分析

1. 违反合伙协议

   • 合伙协议是合伙企业运营的基础，其中通常会明确约定资金的管理、使用和转账等规则。如果法人未经其他合伙人同意，私自将合伙企业的资金转账至个人账户或其他非合伙企业账户，这明显违反了合伙协议的约定，构成违约行为。其他合伙人有权要求法人承担违约责任，包括赔偿损失和将私自转账的款项归还至合伙企业账户。

2. 侵犯财产权益

   • 合伙企业的资金属于全体合伙人共有，法人私自转账，实际上是将本应归属于合伙企业或全体合伙人的资金据为己有，这侵犯了其他合伙人的财产权益。被侵权的合伙人可以通过民事诉讼要求法人返还财产并赔偿损失。

3. 职务侵占罪与侵占罪

   • 如果法人在企业中担任一定职务，如执行事务合伙人等，并利用职务便利，将合伙企业的资金非法占为己有，且数额较大，可能涉嫌职务侵占罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，职务侵占罪将受到法律的严惩。
   • 在一些个人合伙关系中，如果法人合法占有合伙资金但将其非法占为己有，拒不退还，且达到一定数额标准，也可能构成侵占罪。侵占罪属于告诉才处理的犯罪，即由被害人自行向法院提起刑事自诉。

4. 《中华人民共和国合伙企业法》的相关规定

   • 根据《中华人民共和国合伙企业法》的规定，合伙人不得从事损害合伙企业利益的活动。法人私自转账，如果给合伙企业造成损失，依法应承担赔偿责任。同时，如果法人利用职务上的便利，将合伙企业财物非法占为己有，还可能面临行政处罚或刑事责任。

二、行为性质的判断与主观意图

• 法人私自转账的性质需明确，即是否通过合伙企业的正规财务渠道进行。如未经过正规渠道而是个人直接操作转账，可能违反合伙协议和企业规定。
• 主观意图也是判断行为是否违法的重要因素。如果法人私自转账并非出于恶意或欺诈目的，且未给合伙企业造成实际损失，其违法性可能相对较低。然而，如果存在故意隐瞒、欺诈或滥用职权等行为，则可能构成更严重的违法。

三、处理方式和建议

1. 收集证据

   • 发现法人私自转账时，首先应收集相关证据，如转账记录、银行流水、合伙协议、证人证言等，以确保后续法律程序的顺利进行。

2. 内部协商

   • 在掌握充分证据后，可尝试与法人进行内部协商，要求其停止违法行为并退还违法所得。这有助于减少不必要的法律纠纷和成本。

3. 法律途径

   • 若内部协商无果或法人拒绝改正，可向公安机关报案或向人民法院提起诉讼，要求追究法人的法律责任。在此过程中，应详细阐述事实经过、提供充分证据，并明确诉求。

4. 预防措施

   • 为避免类似事件的发生，合伙企业应制定完善的财务管理制度和监督机制，确保每一笔资金的使用都经过严格的审批和记录。同时，加强对合伙人的法律教育和职业道德培训，提高其法律意识和诚信意识。

总结：两人合伙公司中，法人私自转账的行为在多数情况下可能构成违约、侵权甚至犯罪。因此，建议合伙企业在运营过程中加强财务管理和监督，确保资金的安全和合规使用。如果遇到类似问题，应及时收集证据并采取相应的法律措施来维护自身及合伙企业的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。