关于公司女员工超过50周岁公司不缴纳社保是否合法的问题，这主要取决于女员工是否已达到法定退休年龄以及她与公司是否还存在劳动关系。以下是对此问题的详细解答：

一、已达法定退休年龄的情况

1. 若女员工已满足退休条件：女性职工的法定退休年龄一般为50周岁（女干部为55周岁）。如果女员工年满50周岁（或女干部年满55周岁），并且她的养老保险累计缴费已满15年，那么她可以办理退休手续并开始按月领取基本养老金。在这种情况下，公司无需再为她缴纳社保。

2. 若女员工未满足退休条件：

   • 如果女员工虽然年满50周岁，但养老保险累计缴费不足15年，并且她选择继续在公司工作，那么由于此时劳动合同可能终止，双方可能形成劳务关系而非劳动关系，公司可能无法再为她缴纳职工社保。但女员工可以以个人身份继续参保缴费，直至满足领取养老金的条件。
   • 如果女员工以灵活就业人员身份参保，即使超过50岁，只要未达到领取养老金的条件，她通常可以自愿选择继续缴纳社保。

二、未达法定退休年龄的情况

对于50岁以上但未达法定退休年龄的女员工（特别是女干部身份，法定退休年龄为55周岁），如果她们与公司建立了劳动关系，那么公司就有义务按照法律规定为她们缴纳社保。这是强制性的要求，不能免除。

三、法律依据与用人单位责任

根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记，并按时足额缴纳社会保险费。这是公司作为用人单位的法定义务。如果公司未依法为劳动者缴纳社会保险费，劳动者有权向相关部门投诉，并要求公司补缴。同时，公司还可能面临法律制裁和赔偿责任。

四、总结与建议

综上所述，公司女员工超过50周岁公司不缴纳社保是否合法，应依据女员工具体的退休年龄、缴费年限以及与公司的劳动关系来判断。在大多数情况下，只要女员工未达退休年龄且与公司保持劳动关系，公司就需要继续为她缴纳社保。

因此，我建议公司在处理此类问题时，应仔细审查女员工的退休年龄、缴费年限以及劳动关系情况，确保依法为她们缴纳社保。同时，女员工也应及时了解自己的社保缴费情况，并在必要时咨询相关部门或专业人士，以确保自己的权益得到妥善保障。