在银行入职签订补充协议书时，关于上交证件的问题，您应该上交的是证件的复印件，而非原件。

首先，从法律法规的角度来看，根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，也不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。这意味着，任何单位和个人都没有权利扣留他人证件原件，这是为了保护劳动者的合法权益，防止证件被滥用或丢失。

其次，从实际操作的角度来看，上交证件原件存在诸多风险。一方面，证件原件一旦丢失或被盗用，可能会给您带来不必要的麻烦和损失；另一方面，如果用人单位保管不善或存在不当行为，您的证件原件也可能面临被泄露或滥用的风险。因此，为了保障自身权益，您应该坚决拒绝上交证件原件的要求。

那么，在签订补充协议书时，您应该如何操作呢？建议您在需要提供证件时，仅向有关人员出示证件原件以供查验，并在需要提供证件复印或影印件时，在合适位置注明具体用途，如“此复印件仅用于XX银行入职补充协议书签订之用”。这样既可以满足用人单位的查验需求，又可以保障您的证件安全。

最后，如果您在入职过程中遇到任何不合理的要求或侵权行为，如要求上交证件原件、收取不合理费用等，您应该立即向劳动监察部门举报或拨打12333电话进行投诉。同时，您也可以咨询专业律师或法律援助机构，以获取更详细的法律帮助和支持。