关于银行签补充协议书时上交的材料是否会退还的问题，这主要取决于银行的具体规定以及补充协议书中的相关条款，不过我可以结合一般情况和相关法律原则，给您一个较为全面的解答。

首先，从一般情况来看，银行在要求客户签订补充协议书时，可能会要求客户提供一些相关的材料作为证明或备案。这些材料可能包括身份证明、收入证明、资产证明等。在协议签订完成后，银行是否会退还这些材料，并没有一个统一的答案，因为它取决于银行内部的流程和规定。

1. 银行规定与协议条款：

• 有些银行可能会在补充协议书中明确说明，在协议签订完成后，会退还客户提供的所有原始材料。
• 而有些银行则可能规定，某些材料（如身份证明复印件）将作为银行记录的一部分被保留，不再退还。

2. 法律原则与保护：

• 从法律角度来看，银行有义务保护客户的隐私和个人信息安全。如果银行决定保留客户的某些材料，它必须确保这些材料的安全，并防止未经授权的访问或泄露。
• 同时，客户也有权要求银行退还其提供的原始材料，特别是当这些材料对于客户来说具有重要价值或敏感性时。

3. 实际操作建议：

• 在签订补充协议书之前，建议您仔细阅读协议条款，特别是关于材料退还的部分。
• 如果您对协议中的某些条款有疑问或不确定，可以向银行工作人员咨询并寻求明确答复。
• 如果银行拒绝退还您认为应该退还的材料，您可以考虑与银行进行进一步沟通，或者寻求法律援助以保护自己的权益。

4. 特殊情况处理：

• 如果您提供的材料是原件且对于您来说非常重要（如房产证、车辆登记证等），建议您在提交前先进行复印或扫描留存。
• 如果银行因某种原因需要保留您的原件材料，您可以要求银行出具书面说明，明确保留的原因、期限以及退还的条件。

概括起来，银行在签订补充协议书时是否会退还客户提供的材料并没有一个固定的答案。它取决于银行的规定、协议条款以及具体情况。因此，在签订协议前，建议您仔细阅读协议条款并与银行进行充分沟通，以确保自己的权益得到保护。