核心结论取决于车辆过户后的实际运营关系及责任归属，具体分以下两种情况说明：
若车辆已合法过户至公司名下，且驾驶员受公司雇佣或指派执行工作任务
根据《民法典》第1191条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。若罚款系因车辆运营违规（如超载、未按规定路线行驶等）导致，且驾驶员行为属于职务行为，罚款通常由公司承担。例如：公司安排驾驶员运输混凝土时超载被查，处罚对象为公司。
若车辆虽过户至公司，但驾驶员以个人名义承包运营或存在重大过失/故意违规
- 若驾驶员与公司签订承包合同，独立承担运营风险（如自负盈亏），且违规行为与公司无关（如无证驾驶、酒驾），罚款可能直接针对驾驶员。
- 若驾驶员存在重大过失（如明知超载仍驾驶），公司承担责任后可依据内部规定向驾驶员追偿，但行政处罚阶段仍以公司为对象。例如：驾驶员私自改装车辆导致被查，公司需先缴纳罚款，再向驾驶员索赔。
关键点补充说明：
- 车辆过户手续合法性：若过户未完成（如未办理登记），原车主可能需承担连带责任，但题目已明确“过户后”，故不展开。
- 处罚依据：行政处罚决定书会明确载明被处罚主体（公司或个人），需以书面内容为准。
- 建议行动：公司应留存车辆过户文件、驾驶员雇佣合同、运营指令记录等证据，以明确责任归属；若对处罚有异议，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
如有进一步细节（如处罚原因、合同条款等），可直接向我咨询，我会结合具体情形为您分析。