文具店卖课本，如果未取得中小学教科书发行资质，是违法的。具体处理方式如下：

一、法律规定

根据《出版物市场管理规定》第二十八条第一款第（一）项，从事中小学教科书发行业务，必须具备中小学教科书发行资质。若文具店未取得该资质而销售中小学教科书，将构成违法行为。

二、法律后果

1. 行政处罚：根据《出版物市场管理规定》第三十四条及《出版管理条例》第六十五条，未取得中小学教科书发行资质而擅自发行的，由出版行政主管部门没收出版物、违法所得，并根据违法经营额的大小处以罚款。违法经营额不足1万元的，可以处5万元以下的罚款。

2. 情节严重的处理：若情节严重，还可能被责令限期停业整顿或者由原发证机关吊销许可证。

三、实际案例

以长沙市雨花区丝雨文化用品商行为例，该商行因未取得中小学教科书发行资质而擅自销售教科书，被长沙市文化旅游广电局处以罚款1000元，并没收违法所得及剩余教科书。这一案例充分说明了未取得资质销售教科书的法律后果。

四、建议

1. 合规经营：文具店在销售课本前，应确保已取得中小学教科书发行资质，以避免法律风险。

2. 法律咨询：若文具店对相关规定存在疑问或不确定自身是否符合资质要求，应及时咨询专业律师或相关政府部门，以确保合规经营。

综上所述，文具店在未取得中小学教科书发行资质的情况下销售课本是违法的，将面临行政处罚等法律后果。因此，建议文具店在销售课本前务必确保已取得相关资质，以避免不必要的法律风险。