结论：植物新品种权提出申请保护后，在证书未下来的情况下，一般难以直接进行维权，但存在一些特殊途径和考量因素。

详细分析：

1. 从法律维权的一般原则来看：

   • 通常，权利的确认是维权的前提。植物新品种权证书是确认品种权归属和范围的官方文件，具有法律效力。在证书未颁发前，品种权的法律状态尚未明确，因此直接以品种权人的身份进行维权存在法律障碍。

2. 从申请过程中的保护措施来看：

   • 虽然证书未下，但申请人在提交植物新品种权申请后，可以依据相关法律法规，在申请过程中采取一定的保护措施。例如，可以要求侵权方停止侵权行为，并保留相关证据，以便在证书颁发后进一步追究其法律责任。不过，这种保护措施的力度和效果可能相对有限。

3. 从实际维权操作的角度来看：

   • 在证书未下来的情况下，如果发现有人侵犯了申请中的植物新品种权，申请人可以尝试与侵权方进行协商，要求其停止侵权行为并赔偿损失。如果协商无果，申请人也可以考虑向相关行政管理部门投诉或举报，请求其介入调查并处理。但需要注意的是，这些途径可能无法直接达到维权的目的，而是为后续的维权行动积累证据和准备。

4. 从法律程序和证据的角度来看：

   • 在维权过程中，证据的收集和保存至关重要。即使证书未下，申请人也应尽可能收集和保存与侵权行为相关的证据，如侵权产品的样本、销售记录、广告宣传资料等。这些证据在后续的维权行动中可能起到关键作用。

建议：

• 在植物新品种权申请过程中，申请人应密切关注申请进度，及时与相关部门沟通，确保申请能够顺利进行。
• 一旦发现侵权行为，应立即采取措施进行证据收集和保存，并尝试与侵权方进行协商或向相关行政管理部门投诉。
• 在证书颁发后，申请人应尽快以品种权人的身份进行正式维权，以维护自身的合法权益。

特殊情况说明：

• 如果在申请过程中，申请人能够证明其已经对申请中的植物新品种进行了实质性的投入和开发，并且侵权行为对其造成了明显的损失，那么在一些特殊情况下，法院或相关行政管理部门可能会考虑给予一定的保护或支持。但这种情况较为罕见，且需要具体的证据和法律依据来支持。

如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。