结论：小区停车系统不录入业主车牌而进行人工收费是否合法，需根据具体情况判断，包括小区管理规约、物业服务合同内容以及相关法律法规的规定。

分析：

1. 小区管理规约与物业服务合同：

   • 小区的管理规约和物业服务合同是规范小区管理、明确业主与物业公司权利义务的重要文件。如果这些文件中明确规定了停车系统的管理方式，包括车牌录入、收费方式等，那么物业公司应当遵循这些规定。
   • 若管理规约或物业服务合同中明确要求停车系统必须录入业主车牌，并采用自动计费方式，而物业公司却采取人工收费且未录入车牌，这可能构成违约行为，业主有权要求物业公司改正或寻求法律途径解决。

2. 相关法律法规：

   • 根据《物业管理条例》等相关法律法规，物业公司有义务按照合同约定提供服务，包括停车管理服务。如果物业公司未按照约定提供服务，或者提供的服务不符合标准，业主有权要求物业公司承担相应的责任。
   • 同时，如果物业公司的人工收费行为违反了价格法、消费者权益保护法等相关法律法规，如未明码标价、乱收费等，业主也可以向相关部门投诉或寻求法律救济。

3. 特殊情况考虑：

   • 如果小区停车系统因技术故障、升级改造等原因暂时无法录入车牌，且物业公司已采取合理措施（如公告、临时通行证等）保障业主停车权益，同时人工收费行为也符合相关法律法规和合同约定，那么这种行为可能是合法的。
   • 另外，如果小区存在特殊情况，如历史遗留问题、规划变更等，导致停车系统无法录入所有业主车牌，且物业公司已与业主协商并达成一致意见，采取人工收费作为临时或长期解决方案，那么这种行为也可能被视为合法。

建议：

• 业主角度：如果业主对小区停车系统的人工收费行为有异议，首先应查看小区管理规约和物业服务合同中的相关规定。如果认为物业公司的行为违反了合同约定或相关法律法规，可以与物业公司协商解决；协商无果的，可以向相关部门投诉或寻求法律途径解决。
• 物业公司角度：物业公司应严格遵守小区管理规约和物业服务合同中的规定，提供符合标准的停车管理服务。如果因特殊原因需要采取人工收费方式，应及时与业主沟通并达成一致意见，同时确保收费行为符合相关法律法规和合同约定。

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