能否执行被执行人配偶的公司，需分情况讨论，具体如下：
若公司财产属于被执行人与其配偶的夫妻共同财产
- 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，夫妻在婚姻关系存续期间所得的财产，除另有约定外，应认定为夫妻共同财产。若公司财产属于夫妻共同财产，那么在执行过程中，法院有权对这部分财产进行查封、扣押、冻结等执行措施。但需要注意的是，执行时应当保留被执行人配偶的份额，即只能执行属于被执行人的那一部分财产。
- 法律建议：若您认为公司财产属于夫妻共同财产，可以向法院提供相关证据，如婚姻证明、财产来源证明等，申请法院对公司财产进行执行。但务必确保所提供的证据真实、合法、有效，以免因证据不足而承担不利后果。
若公司财产不属于夫妻共同财产，而是被执行人配偶的个人财产
- 法律背景：若公司财产明确属于被执行人配偶的个人财产，如婚前财产、遗嘱或赠与合同中确定只归一方的财产等，那么这部分财产不受执行程序的影响。法院在执行过程中，不得对这部分财产采取执行措施。
- 法律建议：若您认为公司财产不属于夫妻共同财产，而是被执行人配偶的个人财产，可以向法院提出异议，并提供相关证据证明公司财产的归属。法院将依法审查您的异议，并作出相应裁定。
若公司为被执行人配偶单独所有，但被执行人存在转移、隐匿财产等行为
- 法律背景：若被执行人存在转移、隐匿财产等行为，以逃避执行，那么法院有权依法追查被执行人的财产线索，并对其采取相应的执行措施。即使公司为被执行人配偶单独所有，但若被执行人通过不正当手段将财产转移至公司名下，法院仍有权对公司财产进行执行。
- 法律建议：若您怀疑被执行人存在转移、隐匿财产等行为，可以向法院提供相关线索和证据，申请法院对公司财产进行调查和执行。同时，您也可以考虑向公安机关报案，追究被执行人的刑事责任。
在执行过程中，还需注意以下几点：
- 执行程序的合法性：法院在执行过程中，必须严格遵守法定程序，确保执行行为的合法性和正当性。若您认为法院的执行行为存在违法或不当之处，可以向法院提出异议或申请复议。
- 证据的充分性：在申请执行公司财产时，您必须提供充分的证据证明公司财产与被执行人之间的关系。若证据不足或存在瑕疵，可能导致执行申请被驳回或执行效果不佳。
- 执行风险的评估：在执行前，您应对执行风险进行充分评估，包括公司财产的权属情况、执行难度、执行成本等。若执行风险较大或执行成本过高，您可以考虑与被执行人协商解决或寻求其他法律途径维护自己的权益。
若您在执行过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我将根据您的具体情况，为您提供专业、全面的法律建议。