特殊职务作品的著作权主要归属于法人或者非法人组织，但作者仍享有署名权。以下是对这一结论的详细解释和扩展：
一、特殊职务作品的定义与特征
特殊职务作品，通常指的是那些由法人或者非法人组织主持创作，代表其意志，并利用其物质技术条件完成的作品。这类作品往往与单位的业务活动紧密相关，如工程设计图、产品设计图、地图、示意图、计算机软件等。其显著特征在于，作品的责任通常由法人或者非法人组织承担，即作品若出现问题或引发法律纠纷，相关责任将由组织而非个人承担。
二、著作权归属的一般规则
署名权：
- 作者享有署名权，这是表明作者身份并在作品上署名的权利，属于作者的人身权利，不可转让。即使作品被认定为特殊职务作品，作者依然有权在作品上标明自己的身份。
其他权利：
- 除署名权外，著作权的其他所有权利（包括发表权、修改权、保护作品完整权、复制权、发行权、出租权、展览权、表演权、放映权、广播权、信息网络传播权、摄制权、改编权、翻译权、汇编权等）通常由法人或者非法人组织享有。这些组织可以基于这些权利对作品进行各种形式的利用，并有权给予作者相应的奖励。
三、特殊情况下的著作权归属
- 法律、行政法规的规定：在某些情况下，法律、行政法规可能另有规定，对特定类型职务作品的著作权归属作出明确规定。例如，某些行业可能有特殊的行政法规对特定类型职务作品的著作权归属进行特别规定。
- 合同约定：作者与所在组织之间可能存在合同约定，这些约定会影响到著作权的归属。例如，作者与所在单位在合同中明确约定了职务作品的著作权完全归单位所有，甚至包括署名权等。在这些情况下，应遵循相应的合同约定来确定著作权的归属。
四、实际应用案例
以软件公司的小李为例，他在公司的安排下，利用公司提供的专业开发设备、技术资料及资金支持等物质技术条件，开发了一款新的计算机软件。该软件若出现质量问题或引发法律纠纷，都由公司承担责任。在这种情况下：
- 小李对该软件享有署名权，即他有权在软件上标明自己是开发者。
- 软件的发表权、复制权、销售权等其他著作权权利则归公司所有。公司可以根据软件的市场表现及内部规定或与小李的约定，给予其一定的奖励。
五、法律建议
- 明确合同约定：对于职务作品的著作权归属问题，建议作者与所在组织在合同中明确约定，以避免后续可能出现的纠纷。
- 尊重署名权：即使作品被认定为特殊职务作品，作者依然享有署名权。组织在使用作品时，应尊重并保护作者的署名权。
- 合理奖励作者：组织在享有著作权的同时，应根据实际情况给予作者适当的奖励，以激励其创作热情。
综上所述，特殊职务作品的著作权归属是一个既复杂又重要的问题，需要根据具体的法律规定和实际情况进行综合分析和处理。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。