可以起诉，微信账号的注册方式并不影响诉讼的进行。以下从几个方面为你详细分析：

一、诉讼的核心要素

在民事诉讼中，关键在于确定诉讼主体（即原告和被告）以及他们之间的法律关系。微信账号，无论其是通过手机号码还是其他方式注册，都只是用户在网络空间中的一个标识。在诉讼中，我们更关注的是这个标识背后所代表的实际个体或实体，即微信账号的实际使用者。

二、如何确定被告身份

1. 微信账号信息：虽然微信账号的注册方式可能不同，但你可以通过微信平台获取该账号的一些基本信息，如微信号、昵称、头像等。这些信息虽然不足以直接确定被告的身份，但可以作为起诉时的初步证据。
2. 其他证据：为了更准确地确定被告身份，你需要收集其他相关证据。例如，如果你们之间有过交易或沟通，你可以保留相关的聊天记录、转账记录等。这些证据可以显示微信账号的实际使用者与你之间的法律关系，从而帮助你确定被告身份。
3. 申请法院调查：在必要时，你可以向法院申请调查令，要求微信平台提供该账号的注册信息、登录记录等。这些信息有助于你更准确地确定被告身份。

三、诉讼过程中的注意事项

1. 证据收集：在诉讼过程中，证据的收集至关重要。你需要确保所收集的证据真实、合法、有效，并且能够证明你的主张。
2. 法律程序：遵循法律程序是诉讼成功的关键。你需要按照法院的要求提交起诉状、证据材料等，并按时参加庭审等活动。
3. 律师协助：虽然你可以自行起诉，但聘请一位专业律师协助你处理诉讼事务会更为稳妥。律师可以为你提供专业的法律意见，帮助你更好地收集证据、准备诉讼材料，并在庭审中为你辩护。

四、可能面临的挑战及应对

1. 被告身份难以确定：如果微信账号的实际使用者身份难以确定，这可能会给你的诉讼带来一定困难。在这种情况下，你需要更加积极地收集证据，并考虑申请法院调查令来获取更多信息。
2. 证据不足：如果证据不足，法院可能无法支持你的主张。因此，在诉讼前，你需要充分评估自己的证据情况，并尽可能收集更多有力证据。

总结来说，对方不是用手机号码登的微信并不影响你起诉的权利。关键在于你能否通过其他方式确定被告身份，并收集到足够证据来支持你的主张。如果你在诉讼过程中遇到任何困难或疑问，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律意见和帮助。